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应用克隆文库构建法分析马铃薯块茎形成期根系AMF菌群组成
引用本文:任禛,韩丽,夏体渊,陈丽娟,杨瑞萍,王定康.应用克隆文库构建法分析马铃薯块茎形成期根系AMF菌群组成[J].贵州农业科学,2015(5).
作者姓名:任禛  韩丽  夏体渊  陈丽娟  杨瑞萍  王定康
作者单位:1. 昆明学院 农学院,云南 昆明 650214; 云南省高校 都市型现代农业工程研究中心,云南 昆明 650214
2. 昆明学院 农学院,云南 昆明,650214
3. 昆明学院 生命科学与技术系,云南 昆明,650214
基金项目:云南省应用基础研究自筹基金“Bt 基因导入对玉米与 AMF 共生关系及其诱导青枯病抗性的研究”(2013FZ099);昆明学院人才引进基金“克隆文库构建法研究 Bt 棉对根系 AMF 多样性的影响”(YJL12002);昆明学院校级科研项目“缓解马铃薯水分胁迫压力的丛枝菌根筛选研究”(XJL14018);云南省高校优势特色重点学科(生态学)建设项目
摘    要:为弄清马铃薯生产中丛枝菌根真菌的作用,随机采取马铃薯块茎形成期的根系样品,以DNA提取产物为基础,Nested-PCR扩增目的片段,利用该产物构建AMF部分18S rRNA基因克隆文库,运用ARDRA筛选、DNA测序和系统发育树等方法分析丛枝菌根真菌的结构组成。结果表明:文库Coverage C值为89.7%,但Rarefaction曲线不够饱和;获得的8个AMF类型均与免培养的球囊霉属克隆序列相似度较高,其中Seq2、Seq3、Seq5和Seq8代表的摩西球囊霉(Glomus mosseae)、幼套球囊霉(Glomus etunicatum)、近明球囊霉(Glomus claroideum)和地表球囊霉(Glomus versifome)分类地位较为清晰,其余序列可能代表的球囊霉属较新种类。

关 键 词:丛枝菌根真菌  马铃薯  18S  rRNA  基因  克隆文库  系统发育树

Analysis on AMF Community Composition of Potato Roots at Tuber Formation Stage by Applying Clone Library Construction Method
REN Zhen,HAN Li,XIA Tiyuan,CHEN Lijuan,YANG Ruiping,WANG Dingkang.Analysis on AMF Community Composition of Potato Roots at Tuber Formation Stage by Applying Clone Library Construction Method[J].Guizhou Agricultural Sciences,2015(5).
Authors:REN Zhen  HAN Li  XIA Tiyuan  CHEN Lijuan  YANG Ruiping  WANG Dingkang
Abstract:
Keywords:AMF  potato  18S rRNA gene  clone library  phylogenetic tree
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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