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烟草类异黄酮还原酶基因家族的分子克隆
引用本文:陈伟,林叶春,高维常,李春俭,王三根,吕俊,柴友荣.烟草类异黄酮还原酶基因家族的分子克隆[J].中国农业大学学报,2014,19(6):23-34.
作者姓名:陈伟  林叶春  高维常  李春俭  王三根  吕俊  柴友荣
作者单位:贵州省烟草科学研究院, 贵阳 550081;贵州省烟草科学研究院, 贵阳 550081;贵州省烟草科学研究院, 贵阳 550081;中国农业大学 资源与环境学院, 北京 100193;西南大学 农学与生物科技学院, 重庆 400715;西南大学 农学与生物科技学院, 重庆 400715;西南大学 农学与生物科技学院, 重庆 400715
基金项目:贵州省科学技术基金项目(黔科合J字[2011]2340号);贵州省烟草专卖局科技重大专项(2007-04);国家烟草专卖局科技重大专项(Ts-02-20110015)
摘    要:为揭示类异黄酮还原酶(Isoflavone reductase-like,IRL)在烟草次生物质合成和生理功能中的作用,从品种龙里红花烟中克隆普通烟草IRL(NtIRL)基因家族2个成员的全长cDNA和gDNA序列,完成了生物信息学分析、Southern杂交和RT-PCR等分子鉴定。NtIRL1基因为1 946bp,全长cDNA为1 257bp;NtIRL2基因为2 089bp,全长cDNA为1 261bp。NtIRL1和NtIRL2蛋白均为310个氨基酸,分子质量分别为34.652和34.650ku,等电点分别为5.58和5.78。2个蛋白可能发生磷酸化等翻译后修饰,无信号肽,定位于细胞质,但有可能通过跨膜域与质膜发生联系。预测这2个蛋白的K8~G88为AdoHycase(cl09931)保守域,I9~T239为NmrA(pfam05368)保守域,并具有PIP类型蛋白的所有保守性基序和活性残基。预测2个蛋白的二级结构以α螺旋和延伸链为主;三级结构具有PIP酶典型特征,中间有1个催化裂口。BLAST和系统发生分析进一步证实NtIRL家族属于PIP大家族,与IFR的关系比PCBER和PLR更近。Southern blot杂交也证明,普通烟草基因组中有且只有2个IRL基因存在。半定量RT-PCR结果显示,NtIRL1和NtIRL2均在根中优势表达,在地上部各器官中表达很弱或无表达。

关 键 词:烟草  类异黄酮还原酶  分子克隆  基因家族
收稿时间:2014/2/21 0:00:00

Molecular cloning of isoflavone reductase-like gene family from tobacco
CHEN Wei,LIN Ye-chun,GAO Wei-chang,LI Chun-jian,WANG San-gen,LV Jun and CHAI You-rong.Molecular cloning of isoflavone reductase-like gene family from tobacco[J].Journal of China Agricultural University,2014,19(6):23-34.
Authors:CHEN Wei  LIN Ye-chun  GAO Wei-chang  LI Chun-jian  WANG San-gen  LV Jun and CHAI You-rong
Institution:Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China;Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China;Guizhou Academy of Tobacco Science, Guiyang 550081, China;College of Resources and Environmental Sciences, China Agricultural University, Beijing 100193, China;College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Chongqing 400715, China;College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Chongqing 400715, China;College of Agronomy and Biotechnology, Southwest University, Chongqing 400715, China
Abstract:
Keywords:tobacco (Nicotiana tabacum)  isoflavone reductase-like (IRL)  molecular cloning  gene family
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