| 玉米脱水素基因家族的鉴定与分析 |
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| 引用本文： | 赵阳,王玉,蔡慧林,程备久,马庆.玉米脱水素基因家族的鉴定与分析[J].安徽农业大学学报,2015,42(5):657-665. |
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| 作者姓名： | 赵阳 王玉 蔡慧林 程备久 马庆 |
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| 作者单位： | 安徽农业大学生命科学学院,安徽省作物生物学重点实验室,合肥230036 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31201217)和安徽省自然科学青年基金(1508085QC64)共同资助。 |
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| 摘 要： | 脱水素(dehydrin,DHN)属于LEA蛋白第二家族成员,是一种植物中广泛存在的亲水性蛋白,在干旱、低温和高盐等非生物胁迫的环境中起到重要作用。通过生物信息学方法对玉米全基因组DHN家族成员进行了鉴定,并进一步对其系统发育、基因结构、染色体定位和基因复制以及表达模式进行了系统分析。结果显示,在玉米DHN基因家族中共有5个家族成员,多物种系统发育进化树分析、基因结构以及基序分析都表明DHN家族成员在进化上具有高度的保守性。基因复制和物种间微共线性分析表明,在5个玉米DHN基因中存在着1对片段复制基因(ZmDHN1-ZmDHN2),玉米、高粱和水稻3个物种间存在2对直系同源基因(ZmDHN2-Sb04g032250.1,ZmDHN2-Os02g44870.1)。通过转录组表达数据分析表明,玉米DHN家族基因在不同发育时期具有不同的组织表达模式;同时,诱导表达模式分析表明ZmDHN基因的表达受到盐和干旱胁迫的显著诱导。该研究结果将为进一步鉴定玉米DHN家族重要的基因成员并对其开展功能分析奠定基础。
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| 关 键 词： | 玉米 脱水素 进化分析 基因复制 表达模式 |
| 收稿时间： | 2015/5/29 0:00:00 |
Identification and characterization of the dehydrin gene family in maize |
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| ZHAO Yang,WANG Yu,CAI Huilin,CHENG Beijiu and MA Qing.Identification and characterization of the dehydrin gene family in maize[J].Journal of Anhui Agricultural University,2015,42(5):657-665. |
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| Authors: | ZHAO Yang WANG Yu CAI Huilin CHENG Beijiu and MA Qing |
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| Institution: | Key Laboratory of Crop Biology of Anhui Province, School of Life Science, Anhui Agricultural University, Hefei 230036,Key Laboratory of Crop Biology of Anhui Province, School of Life Science, Anhui Agricultural University, Hefei 230036,Key Laboratory of Crop Biology of Anhui Province, School of Life Science, Anhui Agricultural University, Hefei 230036,Key Laboratory of Crop Biology of Anhui Province, School of Life Science, Anhui Agricultural University, Hefei 230036 and Key Laboratory of Crop Biology of Anhui Province, School of Life Science, Anhui Agricultural University, Hefei 230036 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | maize dehydrin phylogenetic analysis gene duplication expression pattern |
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