| 一种新型抗菌肽基因决定簇的克隆与序列结构特征 |
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| 引用本文： | 刘洋,柯晓静,于宏伟,郭润芳.一种新型抗菌肽基因决定簇的克隆与序列结构特征[J].河北农业大学学报,2019,42(1):65-70. |
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| 作者姓名： | 刘洋 柯晓静 于宏伟 郭润芳 |
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| 作者单位： | 河北农业大学食品科技学院,河北保定,071000;河北农业大学食品科技学院,河北保定,071000;河北农业大学食品科技学院,河北保定,071000;河北农业大学食品科技学院,河北保定,071000 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划;河北省自然科学基金 |
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| 摘 要： | 侧孢短芽孢杆菌(Brevibacillus laterosporus)S62-9菌株产生的抗菌肽BBL属于非核糖体合成肽,其生物合成涉及到一系列相关基因。为了获得完整的抗菌肽BBL基因决定簇,本研究基于部分已知的NRPS-A结构域基因序列,以S62-9菌株质粒DNA为模板,采用TAIL-PCR技术对NRPS-A结构域的上游进行扩增,得到一个大小为2.74kb的序列,该序列包含NRPS-A的5′末端序列、pp-binding序列以及1个ABC转运蛋白基因。该序列进一步与已知序列进行序列拼接及软件分析比对,最终获得一个大小为22.2kb的基因簇,该基因簇包含13个Bbl功能结构域,根据功能该基因簇分为3类功能相关基因:一类是编码转运相关蛋白,BblE包含3个ABC转运蛋白,负责抗菌肽向胞外渗透运输;二是催化短肽合成基因,Bbl F包含了pp-binding结构域和NRPS-A结构域,与氨基酸的装载和缩合有关,负责短肽的合成;三是肽链修饰相关基因,Bbl D、Bbl E、Bbl M、Bbl K等基因负责肽的修饰。
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| 关 键 词： | 非核糖体肽合成酶 交错式热不对称 克隆 结构特征 |
Cloning and sequence structural characteristics of a novel antimicrobial peptide gene cluster |
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