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巴西橡胶树HbGRF基因的克隆、物理定位及表达分析
引用本文:张宇航,潘冉冉,李飞,陶志强,王英,高和琼,庄南生.巴西橡胶树HbGRF基因的克隆、物理定位及表达分析[J].热带作物学报,2020,41(9):1723-1732.
作者姓名:张宇航  潘冉冉  李飞  陶志强  王英  高和琼  庄南生
作者单位:1.海南大学热带作物学院,海南海口 5702282.中国热带农业科学院橡胶研究所,海南海口 571101
基金项目:国家自然科学基金项目(31760216);海南省研究生创新科研课题项目(Hys2018-13);国家天然橡胶产业技术体系项目(CARS-33-YZ2)
摘    要:生长调控因子(growth-regulating factors,GRF)是植物特有的一类转录因子,该转录因子家族成员数目较多,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。以巴西橡胶树优良品种‘热研7-33-97’为材料,通过RT-PCR方法进行HbGRF基因的克隆;利用生物信息学的方法对其蛋白序列、理化性质、基因结构、进化关系进行分析;利用IS-PCR技术和FISH技术对其进行物理定位分析;采用qRT-PCR对橡胶树中HbGRF基因的表达模式进行研究。结果表明:在橡胶树雌花中克隆到3个GRF基因,分别命名为HbGRF1HbGRF2HbGRF3,分子量分别为65.663、41.188、52.858 kDa,其编码的蛋白长度分别为609、384、494 aa,均为不稳定蛋白;3个基因均具有GRF完整的特征结构域WRC和QLQ,分别属于3个不同亚族。基因物理定位结果表明,HbGRF1HbGRF2HbGRF3基因分别位于橡胶树染色体的第11号长臂、第5号短臂和第9号长臂上,基因到着丝粒的平均百分距离是77.65、42.66和65.27。表达结果显示,橡胶树3个HbGRF基因在茎尖、雌花等生长旺盛的组织中表达量较高,用外源赤霉素和脱落酸处理后,发现表达量呈上升趋势,经过48 h后表达量和初始值基本持平,3个基因在茎尖、雌花中有明显的表达特异性,可能在橡胶树花芽分化及雌花的发育过程中起到了重要作用。该结果为研究橡胶树HbGRF基因的功能及作用机制奠定了理论基础,为橡胶树精准育种提供了分子细胞学依据。

关 键 词:巴西橡胶树  GRF基因家族  基因定位  表达分析  
收稿时间:2019-09-09

Cloning,Physical Location and Expression Analysis of HbGRF in Hevea brasiliensis
ZHANG Yuhang,PAN Ranran,LI Fei,TAO Zhiqiang,WANG Ying,GAO Heqiong,ZHUANG Nansheng.Cloning,Physical Location and Expression Analysis of HbGRF in Hevea brasiliensis[J].Chinese Journal of Tropical Crops,2020,41(9):1723-1732.
Authors:ZHANG Yuhang  PAN Ranran  LI Fei  TAO Zhiqiang  WANG Ying  GAO Heqiong  ZHUANG Nansheng
Institution:1. College of Tropical Crops, Hainan University, Haikou, Hainan 570228, China2. Rubber Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou, Hainan 571101, China
Abstract:
Keywords:Hevea brasiliensis   GRF gene family  gene mapping  expression analysis  
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