| 绿尾虹雉(Lophophorus lhuysii)Toll样受体5基因的克隆和适应性进化分析 |
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| 引用本文： | 周明,李彪,欧阳菠,钟赟,杨建东.绿尾虹雉(Lophophorus lhuysii)Toll样受体5基因的克隆和适应性进化分析[J].四川农业大学学报,2019(2):232-240. |
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| 作者姓名： | 周明 李彪 欧阳菠 钟赟 杨建东 |
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| 作者单位： | 四川农业大学动物科技学院 |
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| 摘 要： | 【目的】获得绿尾虹雉(Lophophorus lhuysii)Toll样受体5基因(TLR5)编码区序列,并对其编码区蛋白的特征及适应性进化进行分析。【方法】以绿尾虹雉基因组DNA为模板,采用PCR扩增克隆获得TLR5基因编码区序列。使用MEGA、PAML等软件对其序列特征及选择压力进行分析。【结果】绿尾虹雉TLR5基因编码区序列全长2 583 bp,共编码860个氨基酸,以亮氨酸含量最高(133/860),色氨酸含量最低(11/860)。编码蛋白为典型的Ⅰ型跨膜结构,包括富含LRRs结构域的胞外区、跨膜区和胞内TIR结构域。绿尾虹雉TLR5基因极其保守,与雉鸡(P. colchicus)的同源性最高(97.75%),与小白鹭(E. garzetta)同源性最低(85.17%)。采用位点-特异模型在胞外区共检测到3个正选择氨基酸位点(263F, 280K和645I)。【结论】绿尾虹雉TLR5基因编码区受到较强的纯净化压力,胞外区LRRs结构域可能为识别病原微生物的区域。
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| 关 键 词： | 绿尾虹雉 TLR5基因 克隆 适应性进化 |
Cloning and Adaptive Evolution Analysis of Toll-Like Receptor 5 Gene in Chinese Monal(Lophophorus lhuysii) |
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