| 桃NAC基因家族生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张春华,上官凌飞,俞明亮,张彦苹,马瑞娟. 桃NAC基因家族生物信息学分析[J]. 江苏农业学报, 2012, 28(2): 406-414 |
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| 作者姓名： | 张春华 上官凌飞 俞明亮 张彦苹 马瑞娟 |
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| 作者单位： | 1. 江苏省农业科学院园艺研究所,江苏南京,210014
2. 南京农业大学园艺学院,江苏南京,210095 |
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| 基金项目： | 江苏省博士后科研资助项目，国家自然科学基金 |
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| 摘 要： | NAC基因家族是最大的植物特有的转录因子家族之一,因在植物发育和逆境应答过程中起着多样的作用而被广泛关注。为进一步进行桃NAC家族基因鉴定、功能分析等研究提供基础信息,采用生物信息学方法预测了桃NAC基因家族成员数目、在基因组骨架上分布、表达模式、假定蛋白质结构和亚族分类。预测结果显示桃NAC基因家族包含115个假定NAC蛋白质,被分为17个亚族,且与拟南芥中NAC家族基因具有一定的相似性;1个NAC基因分布在11号骨架上,其余分布在1～8号基因组骨架上;对一级结构的分析结果显示桃NAC家族蛋白质分子量和氨基酸数目成正相关,绝大多数是亲水氨基酸,各亚族间等电点没有规律;115个蛋白质的二级结构全部以无规则卷曲为主要构成元件,且它们的三级结构大部分相似。在果皮中表达的NAC家族基因数最多,达到75%;在花芽中表达的NAC家族基因数较少,为1%。
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| 关 键 词： | 桃 NAC基因家族 生物信息学 |
Bioinformatics analysis of NAC gene family in peach |
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| ZHANG Chun-hua , SHANGGUAN Ling-fei , YU Ming-liang , ZHANG Yan-ping , MA Rui-juan. Bioinformatics analysis of NAC gene family in peach[J]. Jiangsu Journal of Agricultural Sciences, 2012, 28(2): 406-414 |
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| Authors: | ZHANG Chun-hua SHANGGUAN Ling-fei YU Ming-liang ZHANG Yan-ping MA Rui-juan |
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| Affiliation: | 1(1.Institute of Horticulture,Jiangsu Academy of Agricultural Sciences,Nanjing 210014,China;2.College of Horticulture,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | peach NAC gene family bioinformatics |
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