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上海及周边地区猪圆环病毒2型基因型分析
引用本文:刘健,周锦萍,王建,鞠厚斌,张维谊,杨德全,刘佩红.上海及周边地区猪圆环病毒2型基因型分析[J].中国兽医寄生虫病,2011,19(1):27-30.
作者姓名:刘健  周锦萍  王建  鞠厚斌  张维谊  杨德全  刘佩红
作者单位:上海市动物疫病预防控制中心,上海,201103
摘    要:采集上海及周边地区猪内脏样本,进行猪圆环病毒2型(Porcine circovirus type 2,PCV-2)病原学检测,并对阳性样本的ORF2序列进行分析和比对。结果显示,发病猪群PCV-2阳性率为39.06%(25/64),健康猪群阳性率为13.51%(5/37),PCV-2总阳性率为29.70%(30/101)。30份阳性样本中PCV-2a亚型为2株,检出率为1.98%(2/101),其余28株均为PCV-2b亚型,检出率为27.72%(28/101)。PCV-2的ORF2序列与已登录的ORF2序列的同源性在90.7%~100%。2株PCV-2a株相互间的同源性为99.6%;28株PCV-2b株的同源性在94.4%~100%,PCV-2b株中只有4株与已登录株DQ141322、AY321984和AY484413株同源性关系最近,处于同一分支中,而另外24株与Q151643中国株同源性关系最近且处于同一分支中。研究结果表明上海及周边地区PCV-2感染比较普遍,发病猪场的感染率远高于健康猪场,且感染率比往年有升高,PCV-2在猪场疫病的爆发和传染中起着重要的协同作用;在PCV-2的感染病例中,PCV-2b亚型为感染的优势毒株;绝大多数PCV-2b ORF2片段的同源性与已登录的一株中国株同源性关系密切,在基因进化树上处于同一分支,但是否可以推断其为PCV-2的另一个亚型有待进一步考证。

关 键 词:猪圆环病毒2型  基因型  分析

MOLECULAR EPIDEMIOLOGY ANALYSIS ON PORCINE CIRCOVIRUS TYPE 2 IN SHANGHAI AND NEIGHBORING AREA
LIU Jian,ZHOU Jin-ping,WANG Jian,JU Hou-bin,ZHANG Wei-yi,YANG De-quan,LIU Pei-hong.MOLECULAR EPIDEMIOLOGY ANALYSIS ON PORCINE CIRCOVIRUS TYPE 2 IN SHANGHAI AND NEIGHBORING AREA[J].Chinese Journal of Veterinary Parasitology,2011,19(1):27-30.
Authors:LIU Jian  ZHOU Jin-ping  WANG Jian  JU Hou-bin  ZHANG Wei-yi  YANG De-quan  LIU Pei-hong
Institution:LIU Jian,ZHOU Jin-ping,WANG Jian,JU Hou-bin,ZHANG Wei-yi,YANG De-quan,LIU Pei-hong (Shanghai Animal Disease Control Center,Shanghai 201103,China)
Abstract:Porcine circovirus type 2 was detected in porcine tissue samples from Shanghai and neighboring area.The positive percentage of PCV-2 was 39.06%(25/64) in sick pigs,13.51%(5/37) in healthy pigs,and 29.70%(30/101) in all samples.The virus isolation rates of PCV-2a genotype and PCV-2b genotype were 1.98 % and 27.72%,respectively.Sequence analysis illustrated that nucleotide homologies of ORF2 of PCV-2a and PCV-2b isolates were 99.6% and 84.4%-100%,respectively.Out of 28 PCV-2b isolates,24 isolates belong to on...
Keywords:Porcine circovirus type 2  genetype  analysis  
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