云南红皮梨bHLH转录因子的生物信息学分析 |
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作者姓名: | 孟富宣 周军 辛培尧 唐军荣 董娇 付海辉 周林涛 徐世宏 |
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作者单位: | 西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室,西南林业大学,昆明650224 |
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基金项目: | 基金项目:本研究由国家林业局948项目“苹果抗性品种及分子辅助育种技术引进”(2013-4-44)、西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室开放基金项H(BC2010F08)、国家林业局重点实验室开放基金(BC2010F08)、云南省省院省校教育合作咨询共建重点学科林学和西南林业大学重点建设学科林木遗传育种(XKX-200904)共同资助 |
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摘 要: | 具有碱性-螺旋-转角-螺旋结构的一大类基因被称为bHLH家族基因,其成员主要有c-MYC、MADL、MAX、MIXL和删r基因;bHLH转录因子在细胞的增殖、分化和凋亡方面起着重要作用;对植物的生长发育、营养吸收、生物合成和信号转导等方面同样有着重要作用。在果肉、叶片和外果皮中,CsMYC2的表达与CHS、UFGT及ANS表达相关联,因此CsMYC2参与花色苷的生物合成调控,但是该基因在云南红皮梨花色苷合成调控中起着什么样的作用尚不清楚。利用生物信息学方法对云南红皮梨(RedPyruspyrifdia)bHLH基因进行分析,对不同植物间bHLH基因氨基酸序列的同源性比对,并且对该基因编码的蛋白质的理化性质、结构和功能等进行预测和分析。结果表明:该蛋白属于亲水性蛋白,其二级结构中的主要结构元件是仅一螺旋和无规则卷曲,并散布于整个蛋白。这一结果为研究红皮梨bHLH基因的结构、功能以及红皮梨的着色机制奠定了一定的基础。
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关 键 词: | 云南红皮梨 bHLH转录因子 生物信息学 |
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