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玉米SSR 引物和甘蔗EST-SSR引物在芒属中的通用性研究
引用本文:卢玉飞,蒋建雄,易自力.玉米SSR 引物和甘蔗EST-SSR引物在芒属中的通用性研究[J].草业学报,2012,21(5):86-95.
作者姓名:卢玉飞  蒋建雄  易自力
作者单位:湖南农业大学生物科学技术学院,湖南长沙,410128
基金项目:国家自然科学基金项目(30971832);国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2011AA10020903)资助
摘    要: 芒属种质资源是芒属能源作物新品种育种的基础。为了给开展芒属的相关遗传分析提供基础,本研究以中国芒属植物全部7个种类为材料,对382对玉米SSR 引物和100对甘蔗EST-SSR 引物的通用性进行研究以筛选有效的微卫星分子标记。筛选分前期筛选以获得初步有效的引物和后期使用这些初步有效的引物对全部供试材料进行扩增2个环节进行。结果表明,在全部84份供试材料中都能实现稳定PCR 扩增且条带清晰、有多态性、能准确判读的玉米SSR 引物和甘蔗EST-SSR 引物分别为39对(10.21%)和13对(13.00%)。这52对引物在所有供试材料中扩增总共得到250条带。其中在芒属中产生220条带,而多态性条带为206条(93.64%),平均每对引物获得3.96条多态性条带。在扩增条带中,出现了不少特异性条带。基于全部250 条带计算得到的遗传相似度(GS)为0.588~0.988。采用非加权类平均法聚类的结果表明,在GS=0.68水平上,中国芒属植物分为两大类:第一类由尼泊尔芒、双药芒、红山茅构成,第二类由芒、五节芒同荻、南荻组成;在GS=0.82水平上,芒与五节芒同荻与南荻分开;在GS=0.88时,芒与五节芒分开。结果初步表明中国芒属植物遗传多样性比较丰富。其中,芒、五节芒、荻和南荻的相似性较高,相似度为0.780~0.988,说明它们之间的遗传距离较近,而尼泊尔芒、双药芒、红山茅同这四者的遗传距离却较远。因此建议在中国芒属植物的遗传改良和新品种选育时,亲本选配可以适当考虑这三者,以拓宽杂交种的遗传基础。

关 键 词:SSR  EST-SSR  引物通用性  中国芒属植物  遗传多样性
收稿时间:2012-03-28

Study on the transferability of maize SSR and sugarcane EST-SSR markers to Miscanthus(Poaceae)
LU Yu-fei , JIANG Jian-xiong , YI Zi-li.Study on the transferability of maize SSR and sugarcane EST-SSR markers to Miscanthus(Poaceae)[J].Acta Prataculturae Sinica,2012,21(5):86-95.
Authors:LU Yu-fei  JIANG Jian-xiong  YI Zi-li
Institution:(College of Bioscience & Biotechnology,Hunan Agricultural University,Changsha 410128,China)
Abstract:
Keywords:
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