| 蒺藜苜蓿耐酸铝性状的全基因组关联分析 |
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| 引用本文： | 姜格格,宋丽莉,郭东林,蔡洪生,郭长虹,束永俊.蒺藜苜蓿耐酸铝性状的全基因组关联分析[J].草业学报,2013,22(4):170. |
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| 作者姓名： | 姜格格 宋丽莉 郭东林 蔡洪生 郭长虹 束永俊 |
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| 作者单位： | 黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院,黑龙江哈尔滨,150025;黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院,黑龙江哈尔滨,150025;黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院,黑龙江哈尔滨,150025;黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院,黑龙江哈尔滨,150025;黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院,黑龙江哈尔滨,150025;黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室哈尔滨师范大学生命科学与技术学院,黑龙江哈尔滨,150025 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划项目，国家科技支撑项目，黑龙江省科技攻关项目，哈尔滨师范大学研发专项 |
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| 摘 要： | 铝毒害是酸性土壤耕种的主要限制因素,每年造成大量作物减产.蒺藜苜蓿是紫花苜蓿的一年生近缘种,广泛分布于世界各地,是紫花苜蓿遗传改良的重要基因资源.本研究利用蒺藜苜蓿群体的耐酸铝性状差异,进行全基因组关联分析,筛选蒺藜苜蓿耐酸铝性状相关的遗传位点,共得到58个与蒺藜苜蓿耐酸铝性状相关的SNP标记.对其周围基因进行功能注释分析,发现这些SNP位点主要参与苜蓿的细胞壁、脂质代谢、环境胁迫响应过程、氧化还原反应过程以及小分子转运等过程.最后,通过基因组选择方法将发掘SNP标记应用到蒺藜苜蓿耐酸铝性状的预测,预测准确性达到0.80,这说明本研究发掘的SNP标记可以用于蒺藜苜蓿及其近缘物种紫花苜蓿耐酸铝性状的遗传改良.
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| 关 键 词： | 蒺藜苜蓿 全基因组关联分析 EMMA 基因组选择 岭回归 |
Genome-wide association mapping of aluminum tolerance in Medicago truncatula |
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| JIANG Ge-ge
,
SONG Li-li
,
GUO Dong-lin
,
CAI Hong-sheng
,
GUO Chang-hong
,
SHU Yong-jun.Genome-wide association mapping of aluminum tolerance in Medicago truncatula[J].Acta Prataculturae Sinica,2013,22(4):170. |
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| Authors: | JIANG Ge-ge SONG Li-li GUO Dong-lin CAI Hong-sheng GUO Chang-hong SHU Yong-jun |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Medicago truncatula genome-wide association mapping efficient mixed model association (EMMA) genomic selection (GS) ridge regression |
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