| 摄食不同种类饵料的鲤肝脏组织miRNA表达谱分析及验证 |
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| 引用本文： | 罗杰,杨淞,杜杰,刘巧,杜宗君,杨世勇,李胜杰,赵柳兰.摄食不同种类饵料的鲤肝脏组织miRNA表达谱分析及验证[J].淡水渔业,2020(1):31-37. |
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| 作者姓名： | 罗杰 杨淞 杜杰 刘巧 杜宗君 杨世勇 李胜杰 赵柳兰 |
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| 作者单位： | 四川农业大学动物科技学院;中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
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| 基金项目： | 国家大宗淡水鱼产业技术体系建设项目(CARS-45-04);中国水产科学研究院院本级基本科研业务费专项 |
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| 摘 要： | MicroRNA(miRNAs)是一类长度为18-25nt的内源性非编码单链小RNA,参与细胞增殖与凋亡、免疫、脂肪代谢等过程。本试验以三组投喂不同类型饵料的鲤(Cyprinus carpio)肝脏为研究材料,通过HiSeq 2500深度测序技术和生物信息学分析miRNA,鉴定出235个已知miRNAs。三种饵料组共表达的差异miRNAs有13个,随机挑选5个miRNA并采用qPCR进行验证,表达趋势在qRT-PCR结果和RNA测序结果中高度相似;对13个共表达的差异表达miRNAs进行靶基因预测,共预测到靶基因530个。对预测靶基因进行KEGG通路分析,结果显示参与2-羰基羧酸代谢,糖基磷脂酰肌醇(GPI)-锚定生物合成,柠檬酸循环(TCA循环)等通路的调节。本研究首次了解鲤摄食不同种类饵料的miRNAs表达特征,可以为深入了解miRNA对鲤摄食不同种类饵料过程的调控作用奠定基础。
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| 关 键 词： | 鲤(Cyprinus carpio) miRNA测序 饵料 肝脏 差异表达miRNA |
Analysis and validation of miRNA expression profiles in liver of Cyprinus carpio feeding with different types of diets |
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| LUO Jie,YANG Song,DU Jie,LIU Qiao,DU Zong-jun,YANG Shi-yong,LI Sheng-jie,ZHAO Liu-lan.Analysis and validation of miRNA expression profiles in liver of Cyprinus carpio feeding with different types of diets[J].Freshwater Fisheries,2020(1):31-37. |
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| Authors: | LUO Jie YANG Song DU Jie LIU Qiao DU Zong-jun YANG Shi-yong LI Sheng-jie ZHAO Liu-lan |
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| Institution: | (College of Animal Science and Technology,Sichuan Agricultural University,Chengdu 611130,China;Key Laboratory of Tropical&Subtropical Fish Breeding&Cultivation of Chinese Academy of Fishery Sciences,Pearl River Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Guangzhou 510380,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Cyprinus carpio miRNA-seq diet liver differential express microRNA |
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