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糜子干旱后复水过程中基因表达谱的初步分析
引用本文:林凡云,胡银岗,宋国琦.糜子干旱后复水过程中基因表达谱的初步分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2007,35(3):81-86.
作者姓名:林凡云  胡银岗  宋国琦
作者单位:1. 西北农林科技大学,农学院,陕西,杨凌,712100;国家小麦改良中心杨凌分中心,陕西,杨凌,712100;陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西,杨凌,712100
2. 西北农林科技大学,农学院,陕西,杨凌,712100;国家小麦改良中心杨凌分中心,陕西,杨凌,712100
基金项目:国家高技术研究计划发展专项经费;西北农林科技大学校科研和教改项目
摘    要:为探索在干旱后复水条件下糜子抗旱种质的基因表达特点,寻找与其复水后快速恢复生长相关的基因,利用抑制消减杂交(Suppressive subtraction hybridization,SSH)技术,以糜子干旱后复水处理叶片的cDNA为tester,干旱胁迫处理叶片的cDNA为driver,构建了一个抑制消减杂交文库。在文库中随机选取100个克隆(插入片段≥250 bp)测序,所获序列去除载体、引物及接头序列后,利用NCBI的BLAST序列比对分析软件分别对GenBank的dbEST数据库和非冗余蛋白数据库进行序列比对分析。序列同源性分析显示,文库中序列的同源基因主要以与新陈代谢、能量代谢、转录、蛋白加工、细胞信号转导及细胞组分生物合成相关的基因为主,其中以新陈代谢及细胞组分生物合成相关的基因数最多,分别占到与已知蛋白同源的EST的22.4%和10.3%。表明植物在干旱后复水条件下产生一系列的信号传导,同时启动相应的转录机制,激活响应基因的表达,以适应逆境的改变。

关 键 词:抑制消减杂交(SSH)  糜子  复水  基因表达谱
文章编号:1671-9387(2007)03-0081-06
收稿时间:2006/2/14 0:00:00
修稿时间:2006-02-14

Gene expression profile analysis of broomcorn millet (Panicum miliaceum L.) during rehydration after serious drought by means of SSH
LIN Fan-yun,HU Yin-gang,SONG Guo-qi,HE Bei-ru.Gene expression profile analysis of broomcorn millet (Panicum miliaceum L.) during rehydration after serious drought by means of SSH[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2007,35(3):81-86.
Authors:LIN Fan-yun  HU Yin-gang  SONG Guo-qi  HE Bei-ru
Institution:1,2(1 College of Agronomy,Northwest A & F University,Yangling,Shaanxi 712100,China;2 Yangling Branch of China National Wheat Improvement Center,Yangling,Shaanxi 712100,China;3 Shaanxi Key Laboratory of Molecular Biology for Agriculture,Yangling,Shaanxi 712100,China)
Abstract:
Keywords:SSH(suppressive subtraction hybridization)  broomcorn millet(Panicum miliaceum L  )  rehydration  gene expression profile
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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