杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析

纤维素合成酶类似蛋白（CSL）作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构，都含有D，D，D，QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物，采用反转录-聚合酶链式反应（RT-PCR）结合cDNA末端快速扩增技术（RACE）成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列，长度为4 150 bp，开放阅读框架为3 396 bp，编码1 132个氨基酸并含有保守的D，D，D，QXXRW天冬氨酸残基序列。应用美国国家生物技术信息中心（NCBI）数据库对获得的基因进行序列分析比对，发现它属于CslD基因家族，命名为ClCslD1基因。多重序列比对结果分析表明，该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides，水稻Oryza sativa，拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71%以上。利用生物软件对其进行生物学分析，为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础。图5参10