黑腹果蝇miRNA前体的预测 |
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引用本文: | 马闯,胡星驰,童潘,黄慧艳.黑腹果蝇miRNA前体的预测[J].中南林业科技大学学报,2010,30(6). |
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作者姓名: | 马闯 胡星驰 童潘 黄慧艳 |
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作者单位: | 华中科技大学,湖北省生物信息与分子成像重点实验室,湖北,武汉,430074;华中科技大学,生命科学与技术学院,湖北,武汉,430074 |
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基金项目: | 国家自然科学基金重大研究计划项目,科技部国家科技基础条件平台建设专项"人类遗传疾病相关基因的生物信息学分析与预测",生物信息学网络计算应用系统-基因结构自动注释系统及其应用项目,国家大学生创新实验计划项目 |
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摘 要: | MicroRNA(miRNA)是一类长度约23 nt的内源性单链小分子RNA,它通过与靶标结合位点区域的碱基互补结合来调控靶标基因的表达。通过寻找潜在的miRNA结合位点预测miRNA前体,首先在黑腹果蝇mRNA的3’UTR区域中搜寻潜在的miRNA结合位点,然后根据碱基配对原则以及miRNA前体的结构序列特征来预测可能存在的miRNA前体。在黑腹果蝇全基因组范围内对其miRNA的预测结果证实了该方法的有效性。该方法还可应用到其他物种的miRNA发现研究中。
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关 键 词: | 生命科学与技术 黑腹果蝇 靶标基因 结合位点 |
Prediction of miRNA in Drosophila melanogaster |
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Abstract: | |
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Keywords: | miRNA |
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