miR168家族进化特性及其在砂梨休眠期的表达模式分析

为了探究miR168家族的进化特性及其在梨休眠进程中的表达模式，通过检索实验室前期构建的砂梨（‘黄花’梨）miRNA文库、转录组数据库和miRBase数据库，得到植物miR168家族成员的成熟体和前体序列。从‘黄花’梨花芽中克隆了两条miR168前体，发现梨miR168家族包含2条前体序列和4条成熟体序列。采用生物信息分析和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)，对梨miR168家族的成熟体序列及前体（pre-miR168）序列进行分析，与已知植物miR168构建系统发育进化树，预测其靶基因，分析其在梨休眠发生进程中的表达情况。结果表明，梨pre-miR168序列均能形成稳定的发夹结构；植物pre-miR168两端序列较保守，而中间序列不保守；mi168成熟体保守性较高，进化树分析表明梨pre-miR168与苹果的亲缘关系最近，miR168成熟体主要分为两大类。梨miR168调控的潜在靶基因主要包含Argonaute1蛋白基因（protein argonaute 1,AGO1）和胼胝质合成酶3基因（callose synthase 3,CalS3）共21条mRNA，都是以裂解靶标的方式进...