| 12个物种miR-302基因簇的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 崔亚茹,张坤山,罗玉萍,李思光.12个物种miR-302基因簇的生物信息学分析[J].广西农业生物科学,2011,30(3):379-384. |
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| 作者姓名： | 崔亚茹 张坤山 罗玉萍 李思光 |
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| 作者单位： | 1. 南昌大学生命科学与食品工程学院,南昌,330031
2. 同济大学医学院,上海,200092 |
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| 摘 要： | 很多microRNA（miRNA）基因在基因组上聚集排列形成miRNA基因簇。miRNA基因簇在进化上较为保守,有其特殊的生物学意义。miR-302基因簇在胚胎干细胞中特异表达,对胚胎干细胞的自我更新和多潜能维持有重要的作用。本文采用miRBase数据库查询和BLAST同源搜索方法共搜寻并分析了12个物种的miR-302基因簇。生物信息学分析表明,这些物种miR-302基因簇均位于LARP7蛋白基因的内含子区,但转录方向与LARP7基因转录方向相反。序列相似性分析显示,同一物种miR-302簇成员间以及不同物种相应miR-302簇成员间相似性均较高。进化分析表明,基因复制可能是miR-302基因簇进化的主要驱动力。
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| 关 键 词： | 基因簇 miR-302 分子进化 |
Bioinformatics Analysis of miR-302 Gene Cluster from 12 Different Species |
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| Cui Yaru,Zhang Kunshan,Luo Yuping,Li Siguang.Bioinformatics Analysis of miR-302 Gene Cluster from 12 Different Species[J].Journal of Guangxi Agricultural and Biological Science,2011,30(3):379-384. |
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| Authors: | Cui Yaru Zhang Kunshan Luo Yuping Li Siguang |
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| Institution: | 1,2＊ 1 College of Life Sciences and Food Engineering of Nanchang University,Nanchang,330031;2 College of Medicine of Tongji University,Shanghai,200092 |
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| Abstract: | There are many miRNA genes clustered in genome.miRNA gene cluster is highly conserved in evolution,with its special biological significance.miR-302 gene cluster,an embryonic stem cell-specific miRNA cluster,plays an important role in maintenance of stem c |
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| Keywords: | Gene cluster miR-302 Molecular evolution |
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