| 核盘菌arom基因的克隆与序列分析 |
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| 引用本文： | 杨谦,于寒颖,李常银. 核盘菌arom基因的克隆与序列分析[J]. 林业研究, 2005, 16(4) |
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| 作者姓名： | 杨谦 于寒颖 李常银 |
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| 作者单位： | 哈尔滨工业大学生命科学与工程系,哈尔滨,150001;哈尔滨工业大学生命科学与工程系,哈尔滨,150001;大庆石油学院石油工程系,大庆,163318 |
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| 摘 要： | ![]()
本文用反向 PCR 方法扩增并分析了核盘菌 arom 基因,以研究核盘菌和其他真菌在该基因之间的进化关系,并为其编码蛋白(AROM)的催化机制研究、植物转基因和蛋白抑制剂设计提供基础。arom基因编码预分支酸芳香族氨基酸(苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸)合成途径中催化第二步到第六步的五功能多肽。序列分析表明核盘菌 arom 基因含有一个4773bp 的编码框,无内含子。推测的蛋白序列含有 1590 个氨基酸,与已知的所有 AROM 蛋白同源。理论分子量(Mw)和等电点(pI)分别是 172658.78D 和 6.45。核盘菌 arom 基因的GC%是 44.94%。根据搜索二级数据库 CDD 和 Prosite 的结果表明该 AROM 蛋白含有五个保守结构域:脱氢奎尼酸合成酶结构域、脱氢奎尼酸脱水酶(脱氢奎尼酸酶)结构域、莽草酸脱氢酶结构域、莽草酸激酶结构域、5 -烯醇丙酮酰莽草酸-3-磷酸合成酶(EPSP 合成酶)结构域和四个模式:两个 EPSP合成酶模式、Ⅰ型脱氢奎尼酸酶活性位点模式和莽草酸激酶模式。通过比对和参照 PIR 数据库显著位点规则发现核盘菌AROM 蛋白含有四个保守碱基。在基因 5′非翻译区-23 和-77位置分别存在 TATA 盒和 CAAT 盒。在基因下游发现有两个位点可能是 polyA 加尾信号。另外还分析了 arom 基因的系统发育。图 5 参 13。
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| 关 键 词： | 核盘菌 arom基因 基因克隆 |
Cloning and sequence analysis of arom gene from Sclerotinia sclerotiorum |
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| YANG Qian,YU Han-ying,,LI Chang-yin. Cloning and sequence analysis of arom gene from Sclerotinia sclerotiorum[J]. Journal of Forestry Research, 2005, 16(4) |
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| Authors: | YANG Qian YU Han-ying LI Chang-yin |
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| Affiliation: | YANG Qian1,YU Han-ying1,2,LI Chang-yin1 1 Department of Life Science and Engineering,Harbin Institute of Technology,Harbin 150001,P. R. China 2 Department of Petroleum Engineering,Daqing Petroleum Institute,Daqing 163318,P. R. China |
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| Abstract: | ![]()
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| Keywords: | Sclerotinia sclerotiorum arom Gene cloning |
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