甜瓜果实成熟相关基因家族的全基因组鉴定及分析 |
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引用本文: | 郭呈宇,柳俊,李园磊,安睿,李星岩,哈斯阿古拉.甜瓜果实成熟相关基因家族的全基因组鉴定及分析[J].华北农学报,2019,34(2). |
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作者姓名: | 郭呈宇 柳俊 李园磊 安睿 李星岩 哈斯阿古拉 |
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作者单位: | 内蒙古大学 生命科学学院,牧草与特色作物生物技术教育部重点实验室,内蒙古 呼和浩特 010070;内蒙古农牧业科学院 作物育种与栽培研究所,内蒙古 呼和浩特 010031;内蒙古大学 生命科学学院,牧草与特色作物生物技术教育部重点实验室,内蒙古 呼和浩特 010070 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;内蒙古自治区自然科学基金;国家级大学生创新创业训练计划项目 |
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摘 要: | 为获得与甜瓜果实成熟相关的基因,选择与乙烯生物合成及信号转导相关的4个基因家族HB(Homeobox)、RIN(Ripening inhibitor)、ETR(Ethylene receptor)、CTR(Constitutive triple reaction),对甜瓜全基因组鉴定,分别获得CmHB家族成员17个、CmRIN家族成员21个、CmETR家族成员3个和CmCTR家族成员20个,通过序列比对和基序分析验证了家族成员鉴定的可靠性。利用转录组测序方法,分析4个基因家族各成员在甜瓜品种河套蜜瓜原种和转反义CmACO1基因的河套蜜瓜品系M9生长期和成熟期果实中的表达量,发现河套蜜瓜原种中13个基因在2个发育时期果实中的表达量存在显著性差异,其中CmHB3、CmHB11生长期的表达量是成熟期的42,9倍,而CmHB4成熟期的表达量是生长期的27倍,其表达量均呈极显著差异。在M9品系中,12个基因在2个发育时期果实中的表达量存在显著差异,其中CmHB3、CmHB11生长期的表达量是成熟期的6,3倍,而CmHB4成熟期的表达量是生长期的41倍,其表达量均呈极显著差异。在生长期,CmHB3、CmHB11的表达量在2个材料中存在极显著差异,CmRIN14、CmRIN15存在显著差异。而在成熟期,CmHB3的表达量在2个材料中存在极显著差异,CmRIN14、CmRIN15存在显著差异。此外,还发现CmRIN14、CmRIN15在2个材料间的表达模式相反,表明其表达模式受CmACO1表达水平的影响。
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关 键 词: | 甜瓜 乙烯 果实成熟 乙烯受体 CTR |
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