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三个猪品种Myf5基因的克隆及序列分析
引用本文:袁恬,冉雪琴,王芳,陈颖,王嘉福,张兆强.三个猪品种Myf5基因的克隆及序列分析[J].贵州大学学报(农业与生物科学版),2013,32(2):114-118.
作者姓名:袁恬  冉雪琴  王芳  陈颖  王嘉福  张兆强
作者单位:1. 贵州大学生命科学学院,贵州贵阳,550025
2. 贵州大学动物科学学院,贵州贵阳,550025
3. 贵州大学生命科学学院,贵州贵阳550025;贵州大学农业工程省重点实验室,贵州贵阳550025
基金项目:国家科技支撑计划项目"高寒山区高效循环养殖(优质猪)关键技术研究与集成示范",国家863计划课题"中国地方猪种优异特色性状的功能基因组学研究",贵州省优秀科技教育人才省长专项资金"猪肌细胞生长分化相关基因及调节机制研究"
摘    要:为明确猪Myf5基因的蛋白结构及功能位点,从香猪、大白猪和大白×长白杂交猪背最长肌提取总RNA,采用RT-PCR技术克隆Myf5基因,其cDNA长893 bp,包括完整的开放阅读框768 bp,编码255个氨基酸。将所测序列与GenBank上已知猪种序列进行相似性比较,结果表明:香猪Myf5基因中有3个碱基变异,其中2个突变不改变编码的氨基酸为无义突变,1个突变使其编码的氨基酸由甲硫氨酸(M)变为亮氨酸(L)。大白猪没有碱基变化;大白×长白杂交猪Myf5基因中的1个突变,使其编码氨基酸由甘氨酸(E)变为谷氨酸(G)。将香猪与其他物种进行核苷酸和氨基酸编码区序列的相似性分析及生物信息学分析。相似性分析表明,香猪Myf5基因氨基酸编码区序列与绵羊、牛、马、兔、黑猩猩、非洲象和小鼠的相似性较高,均在88%以上,推测Myf5基因在哺乳动物具有一定的保守性;Myf5蛋白二级结构以无规则卷曲为主,其次为α螺旋,偶有β转角。预测Myf5蛋白不含信号肽序列,有29个磷酸化位点。

关 键 词:香猪  Myf5  基因克隆  序列分析

Cloning and Sequence Analysis of Myf5 Gene in Three Pig Breeds
YUAN Tian , RAN Xne-qin , WANG Fang , CHEN Ying , WANG Jia-fu , ZHANG Zhao-qiang.Cloning and Sequence Analysis of Myf5 Gene in Three Pig Breeds[J].Journal of Mountain Agriculture & Biology,2013,32(2):114-118.
Authors:YUAN Tian  RAN Xne-qin  WANG Fang  CHEN Ying  WANG Jia-fu  ZHANG Zhao-qiang
Institution:1(1.College of Life Sciences,Guizhou University,Guiyang Guizhou 550025,China;2.Key Laboratories for Agricultural Bioengineering of Guizhou Province,Guiyang Guizhou 550025,China;3.College of Animal Sciences,Guizhou University,Guiyang Guizhou 550025,China)
Abstract:
Keywords:
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