基于全基因组牛樟芝中萜烯合成酶的鉴定与表达分析 |
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引用本文: | 罗玛妮娅,王毅,张璋,原晓龙,张雪蕊,郑元.基于全基因组牛樟芝中萜烯合成酶的鉴定与表达分析[J].分子植物育种,2023(1):130-137. |
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作者姓名: | 罗玛妮娅 王毅 张璋 原晓龙 张雪蕊 郑元 |
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作者单位: | 1. 西南林业大学林学院;2. 云南省林业和草原科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室;3. 鲁东大学生命科学学院 |
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摘 要: | 萜烯合成酶(terpene synthases, TPS)是一类异戊二烯环化酶,是真菌萜类化合物生物合成的关键酶之一。为深入了解牛樟芝的萜烯合成酶基因功能,本研究利用BLAST比对获得14个牛樟芝萜烯合成酶(AcTPS)基因,并通过生物信息学方法对其产物蛋白进行功能预测,利用半定量PCR分析不同碳氮源培养基对牛樟芝萜烯合成酶基因表达的影响。结果表明,14个AcTPS蛋白的氨基酸数量为317~2 693个;理论等电点平均pI值为5.96,有6个蛋白(AcTPS6, Ac TPS9, AcTPS10, AcTPS11, AcTPS13, AcTPS14)不稳定系数>40,均为不稳定蛋白;AcTPS12脂肪系数>100,为疏水性蛋白。基因表达谱数据显示,10个牛樟芝萜烯合成酶有6个基因在不同培养基上表达量差异显著,其中AcTPS7只在葡萄糖和土豆蛋白胨培养基中表达,AcTPS10在葡萄糖培养基的表达量高,AcTPS3、AcTPS8及AcTPS6在番茄浸粉培养基中表达量显著,AcTPS2在麦芽浸粉培养基中表达量较高,推测不同培养基能够调控牛樟芝萜烯合成酶的表达。本研究结果为深入研究...
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关 键 词: | 牛樟芝(Antrodia cinnamomea) 萜烯合成酶 生物信息学表达分析 基因表达分析 |
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