光皮树基因组SSR特征分析

光皮树是重要的木本油料树种，为了探究光皮树的遗传背景，本研究利用高通量测序技术对光皮树基因组进行了测序，并利用MISA软件开展SSR位点信息搜索和分析，共检索到重复单元长度为2～6个核苷酸的SSR位点200 558个，SSR的发生频率为15.27%，平均分布距离为1/4.47 kb。二核苷酸重复类型SSR数量最多，所占比例为67.74%,SSR中优势重复基元富含A/T核苷酸。4次重复的SSR数量最多，占总数的21.40%，重复次数在4～10次的SSR数量占总数的82.49%。SSR基序长度在12～90 bp之间，其中12 bp的SSR数量最多，占总数的32.46%，基序长度在12～20 bp的SSR数量占总数的70.58%。研究结果表明，光皮树基因组SSR数量及类型较丰富，为光皮树SSR分子标记的开发、种质资源遗传评价、分子标记辅助育种等提供基础。