黄瓜CsPYCR的克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 王天恩,李奇峰,文云红,尹茵,盛云燕,李丹丹,萨日娜,张帆.黄瓜CsPYCR的克隆及生物信息学分析[J].分子植物育种,2023(24):8020-8027. |
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作者姓名: | 王天恩 李奇峰 文云红 尹茵 盛云燕 李丹丹 萨日娜 张帆 |
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作者单位: | 黑龙江八一农垦大学园艺园林学院 |
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摘 要: | 本研究以黄瓜低霜霉威残留品系‘D0351’为材料,克隆了在霜霉威胁迫后上调表达的基因Cs PYCR,并采用生物信息学方法对该基因进行分析,以明确该基因在降低黄瓜果实内霜霉威残留过程中的作用机制,为下一步通过遗传转化试验鉴定基因功能提供理论基础。结果表明:该基因全长831 bp,编码276个氨基酸,属于PLN02688蛋白家族。该基因编码的蛋白质有可能为细胞质中的疏水蛋白质,无明显信号肽,无跨膜结构。与甜瓜(XM_008457466.2)同源性较高。该基因启动子中包括与乙烯、脱落酸等激素相关的顺式作用元件以及防御和应激反应相关的顺式作用元件,且含有多个与逆境胁迫相关的MYB家族蛋白转录因子结合位点,推测其可能在降低黄瓜霜霉威农药残留过程中发挥重要作用。
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关 键 词: | 黄瓜 CsPYCR 基因克隆 生物信息学分析 |
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