玉米ACA基因家族生物信息学分析

ACA (IIB型Ca²⁺-ATPase)作为Ca²⁺-ATPase的亚家族成员之一，参与植物细胞内钙离子浓度维持，并在植物生长发育和非生物胁迫响应等方面发挥重要作用。为进一步了解玉米ACA (ZmACA)基因家族功能，本研究利用生物信息学方法对ZmACA家族基因进行鉴定与分析。结果表明：玉米共有20个ACA家族基因，命名为ZmACA1～ZmACA20；蛋白质结构具有相似性，氨基酸数目、亲水性指数差异均较小，多数为酸性不稳定的蛋白质。亚细胞定位预测结果显示，ZmACA家族蛋白主要定位于细胞膜、叶绿体、内质网、液泡等部位。进化树分析将ZmACA蛋白分为5个亚家族GroupⅠ～GroupⅤ，其中GroupⅠ～GroupⅣ亚族成员与水稻(Oryza sativa L.)和拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)的亲缘关系较近。蛋白质互作网络(protein-protein interaction network, PPI)预测结果表明，ZmACA6可能与15个蛋白直接互作，是ZmACA家族蛋白的核心成员。ZmACA家族基因在玉米10...