首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

苦荞糖转运载体FtSWEETs的鉴定与生物信息学分析
引用本文:梁成刚,关志秀,章洁琼,韦春玉,石桃雄,黄娟,邓娇,孟子烨,汪燕.苦荞糖转运载体FtSWEETs的鉴定与生物信息学分析[J].分子植物育种,2023(9):2872-2880.
作者姓名:梁成刚  关志秀  章洁琼  韦春玉  石桃雄  黄娟  邓娇  孟子烨  汪燕
作者单位:1. 贵州师范大学生命科学学院,荞麦产业技术研究中心;2. 贵州省农作物技术推广总站
摘    要:植物SWEET转运蛋白是介导糖类进行跨膜运输的重要载体。本研究基于苦荞转录组测序数据库,筛选到34个FtSWEETs基因。基因序列分析发现,苦荞FtSWEETs基因序列长度为533~2 890 bp,编码氨基酸残基为51~327个。聚类分析发现,苦荞FtSWEETs被归为4类,4个属于类型I,9个属于类型Ⅱ,6个属于类型Ⅲ,11个属于类型Ⅳ。蛋白序列分析发现,29个FtSWEETs的最长开放阅读框(MaxORF)编码蛋白具有跨膜结构域。基于苦荞茎的转录组测序分析,共检测到15个FtSWEETs基因在苦荞幼苗茎中表达,包含11个差异表达基因(DEGs)。其中,4个DEGs在出苗后5 d的茎中高表达,随后急剧下降;4个DEGs在出苗后5~15 d的茎中表达量逐渐下降;1个DEG在出苗后10和15 d的茎中高表达,2个DEGs在出苗后15 d的茎中高表达,推测这可能与它们在不同发育阶段发挥特定功能有关。相关性分析发现苦荞FtSWEETs基因间存在多个显著正相关或负相关关系,说明其可能存在协同或功能互补效应。本研究为进一步探索苦荞糖转运的分子调控机制提供了依据。

关 键 词:苦荞  糖转运体  生物信息学  基因表达
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号