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茎瘤芥β-半乳糖苷酶家族基因鉴定及表达分析
引用本文:杜丽娜,汤泽慧,吴小容,陈春帆,赖彪.茎瘤芥β-半乳糖苷酶家族基因鉴定及表达分析[J].分子植物育种,2023(2):472-486.
作者姓名:杜丽娜  汤泽慧  吴小容  陈春帆  赖彪
作者单位:长江师范学院现代农业与生物工程学院
摘    要:植物β-半乳糖苷酶(β-D-galactosidases, BGAL, EC 3.2.1.23)是糖苷水解酶家族35(GH35),在植物细胞壁生成和组分修饰中具有重要作用。为探索BGAL家族基因在茎瘤芥的茎发育中的功能,本研究从茎瘤芥基因组中鉴定到39个BjuBGAL家族成员,并运用生物信息学对其进化关系、蛋白理化性质、基因结构及保守序列、染色体定位和在茎膨大过程中的表达等进行系统分析。结果表明,39个BjuBGAL家族成员,分为8个亚族,相同亚族具有类似基因结构和保守序列;有35个BjuBGAL分别定位于A和B亚基因组中的9和7条染色体上;BjuBGAL启动子具有光、植物激素和胁迫响应的顺式作用元件;转录组数据表明10个BjuBGAL在茎膨大过程中明显上调,进一步利用荧光定量PCR分析发现BjuBGAL4-2随着茎的膨大呈显著上调,且在茎的内髓区表达水平显著高于外髓区,可能参与茎内髓区的发育。本研究为进一步揭示茎瘤芥BGAL家族的功能提供参考。

关 键 词:茎瘤芥(Brassica  juncea  var.  tumida)  β-半乳糖苷酶  基因家族  茎膨大
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