葡萄NBS-LRR基因家族的鉴定与表达分析

为了克隆葡萄中NBS-LRR基因家族成员，并对其功能进行鉴定。以‘黑比诺’葡萄试管苗为试验材料，采用RT-PCR克隆葡萄NBS-LRR基因家族并进行生物信息学分析，结合芯片表达数据及RT-qPCR技术分析了该家族基因在非生物胁迫下的表达情况。结果表明，从葡萄中克隆得到41个NBS-LRR成员，对其编码的蛋白分析表明，分子量在56 362.76～177 974.27 Da之间，等电点(pI)介于5.31～9.54，有11个成员分布在未知染色体上，其他成员分别定位在8条染色体上；二级结构以α-螺旋和不规则卷曲为主。RT-qPCR结果显示，VvNBS-LRR08在50μmol/L JA和400 mmol/L NaCl处理24 h后表达水平达到对照的760倍以上，VvNBS-LRR03和VvNBS-LRR28在400 mmol/L NaCl处理后表达水平分别为对照的3.5和1.3倍，10%PEG处理后VvNBS-LRR03和对照无显著差异，而VvNBS-LRR28表达水平下调显著；VvNBS-LRR05和VvNBS-LRR40在10%PEG处理24 h表达水平分别为对照的1.3和3.6倍，Vv...