摘 要: | 虎尾轮(Uraria crinita (L.) Desv. ex DC)为闽南民间常用保肝护肝中草药,是一种极有使用、研究、开发价值的天然药用植物资源,但对其分子机制研究严重滞后,在一定程度上限制了该民间资源的利用和开发。本实验通过Illumina Hiseq对虎尾轮的根和茎转录组测序,采用Trinity软件完成虎尾轮高质量数据转录本拼装,而后进行生物信息学分析。研究结果表明:总共获得的高质量unigene有255 407 896个,N50的长度是992 bp,其平均长度是559.07 bp;将虎尾轮的122 207条unigene与NR、GO、KEGG等7个重要的数据库系统进行比对,获得了虎尾轮基因功能的注释信息,结果表明,有75 530条unigene至少注释到1个数据库,占61.8%;虎尾轮的根对茎的差异表达unigene有19 714个,其中有9 038个上调表达,10 676个下调表达。在对虎尾轮根与茎差异基因分析中,利用KEGG数据库代谢途径对132个显著性KO途径分析,发现共挖掘出114个unigene与虎尾轮黄酮类生物合成途径密切相关。提取虎尾轮转录组中与黄酮类生物合成...
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