| 次生代谢相关ceRNA调控网络在胡杨异形叶发生中的作用分析 |
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| 引用本文： | 秦少伟,李才林,吴海柱,闫伟伟,何志贵,赵利峰,邢雪琨.次生代谢相关ceRNA调控网络在胡杨异形叶发生中的作用分析[J].分子植物育种,2023(10):3253-3263. |
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| 作者姓名： | 秦少伟 李才林 吴海柱 闫伟伟 何志贵 赵利峰 邢雪琨 |
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| 作者单位： | 1. 桂林旅游学院休闲与健康学院;2. 桂林医学院公共卫生学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(32160235)；;广西省自然科学基金项目(2021GXNSFAA220090)；;河南省高等学校青年骨干教师培养计划项目(2019GGJS153)共同资助； |
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| 摘 要： | 为了探究胡杨异形叶发生的分子机制，本研究以胡杨的四种异形叶(线形,披针形,卵圆形,阔卵形)为材料，利用链特异性转录组测序鉴定了胡杨异形叶中的lncRNA和circRNA，建立了它们的表达谱，筛选出差异表达的lncRNA和circRNA，构建了它们的ceRNA调控网络，用Gene Ontology对它们的靶基因(mRNA)进行了注释和分类，确定了参与次生代谢的lncRNA和circRNA，分析了它们在胡杨异形叶发生中的作用。结果表明，在胡杨异形叶中，共有4 460个lncRNA (其中442个为新发现)和1 149个circRNA (全部为新发现)，鉴定出差异表达的371个lncRNA和24个circRNA，根据ceRNA机制和它们的靶基因的功能，发现参与次生代谢的有26个lncRNA和13个circRNA。研究还发现，lncRNA在披针形和卵圆形叶的表达模式最相似，与线形叶的差别最大，而circRNA则在线形和披针形叶的表达模式最相似，与阔卵形叶的差别最大，根据受它们调控并差异表达的mRNA的功能，发现它们主要参与木质素的代谢，还与萜类和酚类的代谢以及发育过程相关。本研究表明lncRN...
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| 关 键 词： | 胡杨异形叶 次生代谢 ceRNA lncRNA circRNA 调控 |
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