生物信息学鉴定分析茄子脂肪酸去饱和酶(FAD)基因家族 |
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引用本文: | 朱宗文,张爱冬,吴雪霞,查丁石.生物信息学鉴定分析茄子脂肪酸去饱和酶(FAD)基因家族[J].分子植物育种,2023(8):2453-2463. |
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作者姓名: | 朱宗文 张爱冬 吴雪霞 查丁石 |
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作者单位: | 上海市农业科学院园艺研究所,上海市设施园艺技术重点实验室 |
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基金项目: | 国家现代农业产业技术体系建设资金项目(CARS-23-G-40)共同资助; |
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摘 要: | 脂肪酸去饱和酶(FAD)广泛分布于生物体内,其主要功能是在脂肪酸的生物合成过程中,从碳链中去除氢,从而产生碳碳双键。利用拟南芥FAD家族基因和茄子基因组数据,对茄子基因中可能含有的FAD基因进行鉴定和生物信息学分析。共鉴定出茄子FAD基因家族成员38个,其中FAB亚家族成员5个。对家族成员进行蛋白理化性质分析、系统进化分析和保守结构域分析,发现各亚家族成员间具有较为相似的保守基因序列和蛋白特性;基因结构分析表明,FAD家族成员间存在着不同的基因结构,但聚为一类的亚家族基因具有进化的保守性;染色体定位显示茄子FAD家族成员主要分布在5号染色体、6号染色体和4号染色体上。亚细胞定位预测茄子FAD家族成员主要分布在内质网、叶绿体和质膜上,FAB亚家族则全部定位在叶绿体上。
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关 键 词: | 脂肪酸去饱和酶(FAD) 茄子(Solanum melongena L.) 基因家族 |
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