瓠瓜MYB家族成员鉴定及响应白粉病菌的表达分析

为了探讨瓠瓜(Lagenaria siceraria) MYB转录因子家族的功能，本研究基于瓠瓜的全基因组和白粉病菌侵染后的转录组数据，利用生物信息学软件对Ls MYB家族成员进行了鉴定、分析。结果表明：在瓠瓜全基因组中共鉴定到174个LsMYBs基因，其氨基酸数为103～1 673个，均为亲水性蛋白；亚细胞定位预测表明，118个LsMYB基因定位在细胞核中；根据MYB结构域重复数，可将瓠瓜MYB分为1R、2R (R2R3)、3R三个类型，其中2R类型和1R类型分别占比51.1%、47.7%；进化树分析显示，瓠瓜MYB基因家族可被分成31个亚组，推测相同亚组上的瓠瓜与拟南芥的MYB转录因子可能具有相似的功能；利用MEME软件预测得到15个motif元件，分析发现不同MYB的motif数量及分布存在一定差异，同一亚组MYB蛋白具有相似的结构特征；顺式作用元件表明，LsMYB基因启动子区域包含光响应、激素应答、生物及非生物胁迫等相关作用元件和结合位点，表明瓠瓜MYB基因家族可能广泛参与了瓠瓜的生长发育、激素调控、生物/非生物胁迫的响应；瓠瓜接种白粉病菌后MYB家族成员表达量分析表明，推测与...