转录组学挖掘黑果枸杞中花青素生物合成代谢关键bHLH调控基因 |
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引用本文: | 包雪梅,胡娜,宗渊,王洪伦.转录组学挖掘黑果枸杞中花青素生物合成代谢关键bHLH调控基因[J].分子植物育种,2023(6):1864-1873. |
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作者姓名: | 包雪梅 胡娜 宗渊 王洪伦 |
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作者单位: | 1. 中国科学院西北高原生物研究所,中国科学院藏药研究重点实验室;2. 青海师范大学教育学院;3. 中国科学院大学;4. 中国科学院西北高原生物研究所,青海省作物分子育种重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31800297); |
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摘 要: | 黑果枸杞果实中富含花青素,为探究黑果枸杞和白果枸杞的基因表达差异,挖掘控制黑果枸杞黑果性状的主效基因,本研究利用RNA-Seq技术对黑果枸杞和白果枸杞进行转录组测序与生物信息学分析。结果表明,黑果枸杞和白果枸杞中共检测到25 279个基因差异表达,其中12 381个基因在黑果枸杞表达上调,12 898个基因表达下调。KEGG富集结果显示,共有571个差异表达基因参与植物次生代谢产物合成,尤其是在黄酮类和花青素生物合成代谢通路中差异最为明显。黑果枸杞中共有8个参与花青素合成代谢的结构基因的表达量均高于白果枸杞,说明花青素的生物合成可能与黑果枸杞黑果性状相关。调控花青素生物合成的bHLH转录因子CL8159.Contig5_All的表达水平比白果枸杞增强了2 139.57倍,这个基因很有可能是控制黑果枸杞黑果性状的候选基因。本研究筛选到控制黑果枸杞花青素合成代谢的候选基因,为黑果枸杞的分子遗传机理及进一步的基因功能研究提供了依据。
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关 键 词: | 黑果枸杞 白果枸杞 差异表达 花青素 |
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