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牦牛G蛋白信号转导调节因子2克隆及序列分析
作者姓名:李雪峰  王利  李键  字向东  文勇立  钟金城  江明锋  兰道亮  熊显荣
作者单位:西南民族大学动物遗传育种学国家民委-教育部重点实验室
基金项目:中央高校基本科研业务费专项资金项目(2014NZ YQN45);国家民委牦牛遗传资源保护与利用创新团队项目;国家自然科学基金项目(31172198);西南民族大学研究生学位点建设项目(2013XWD-S071007)
摘    要:为了初步探讨牦牛RGS2基因的结构和功能,试验采用RT-PCR方法及TA克隆法得到麦洼牦牛RGS2基因,并运用不同的生物信息学软件对序列进行分析。结果表明:牦牛RGS2基因系列含1个540 bp的开放阅读框,共编码178个氨基酸,Gen Bank数据库中登录号为FJ786041。编码Phe的密码子UUU、编码Leu的密码子UUG、编码Ile的密码子AUU等20种密码子为该基因的偏好性密码子,确定的27种最优密码子均以G或C结尾。RGS2氨基酸序列与普通牛、绵羊、山羊相似性分别为99.5%、96.3%、96.1%。系统发育树上,牦牛与普通牛聚在一起,亲缘关系最近。

关 键 词:麦洼牦牛  RGS2基因  克隆  序列分析  密码子偏好性
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