鸡HMG box蛋白1(HBP1)基因启动子区多态性与腹脂率关联分析

为探讨HMG box蛋白1(HMG box protein 1,HBP1)基因启动子区多态性对鸡腹脂率的影响,以东北农业大学高、低脂双向选择品系第十九世代肉鸡为试验材料,采用直接测序法检测HBP1基因多态性和个体基因型,共获得168个SNPs位点基因型。应用滑动窗口法对位于该基因启动子区54个多态性位点构建单倍型,分别开展单位点和单倍型与鸡腹脂率的关联分析。结果表明,HBP1基因启动子区有7个(g.-5335GA、g.-4354TA、g.-3328CT、g.-3327GA、g.-1013TC、g.-990GA和g.-159AC)位点显著影响肉鸡腹脂率(P0.05)。此外,等位基因频率分析显示,这些位点等位基因频率在两系间分布存在极显著差异(P0.0001)。研究结果表明,HBP1基因为影响鸡腹脂率重要候选基因,7个多态性位点为影响鸡腹脂率重要分子标记。