千穗谷TALE转录因子家族的生物信息学分析 |
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引用本文: | 周敏,周涛,徐倩,卢蕊,刘明稀,胡龙兴.千穗谷TALE转录因子家族的生物信息学分析[J].草地学报,2023,31(3):676-687. |
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作者姓名: | 周敏 周涛 徐倩 卢蕊 刘明稀 胡龙兴 |
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作者单位: | 1. 湖南农业大学农学院草业科学系, 湖南 长沙 410128;2. 湖南省草地研究中心, 湖南 长沙 410128 |
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基金项目: | 山东省重点研发计划(农业良种工程)(2022LZGC018),中国科学院战略性先导科技专项(A类)(No.XDA26050201)和湖南省教厅项目(21A0126)资助 |
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摘 要: | TALE转录因子广泛存在于植物中,对植物的生长发育和对外界环境的响应发挥着重要作用。本研究在千穗谷(Amaranthus hypochondriacus)基因组中共鉴定出11个TALE基因。系统发育分析将千穗谷TALE家族蛋白分为BELL和KNOX两个亚家族,同一亚家族中的AhTALEs基因具有相似的基因结构,编码蛋白也具有类似的结构域。蛋白二级结构和三级结构分析都表明AhTALEs蛋白由螺旋-角-螺旋的结构构成。此外,对千穗谷与其他物种的TALE基因共线性关系、组织表达特性和AhTALEs基因启动子区的顺式作用元件分析发现,不同AhTALEs亚家族在各组织中的表达模式不同,并且发现启动子区包含大量非生物胁迫和激素响应元件,这为AhTALE家族的进化分析提供了依据。qRT-PCR分析发现AhTALEs基因在低温和干旱胁迫下的表达水平有不同程度的变化,表明AhTALEs基因能够响应低温和干旱胁迫应答。本研究为开展千穗谷中TALE转录因子在非生物胁迫中的生物学功能研究提供了重要参考。
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关 键 词: | 千穗谷 TALE 基因家族 低温 干旱 |
收稿时间: | 2022-08-22 |
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