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华南地区猪流行性腹泻病毒的分子流行病学调查与分析
引用本文:王栓群,孙瑞芹,刘燕玲,等.华南地区猪流行性腹泻病毒的分子流行病学调查与分析[J].广东农业科学,2015,42(6):91-96.
作者姓名:王栓群  孙瑞芹  刘燕玲  
作者单位:1. 河南农业大学牧医工程学院,河南郑州,450000
2. 广东省农科院动物卫生研究所,广东广州,510640
基金项目:广东省科技厅项目,广州市科技计划项目,广东省生猪产业体系项目
摘    要:为了解华南地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行、变异及进化情况,从该地区的不同猪场采集2 159份样品,利用RT-PCR方法检测PEDV,扩增了部分PEDV阳性样品中的S、M和ORF3基因并测序,利用生物信息学软件进行序列分析.结果显示,PEDV在猪场中的检出率为100%,在所有样品中的平均检出率为53.0%,在哺乳仔猪、断奶仔猪、育肥猪和母猪样品中,PEDV平均阳性率分别为67.6%、42.8%、12.8%和47.2%.根据S、ORF3和M基因建立的进化树,PEDV可分为2个基因群,其中当前样品株为一群,韩国、美国和中国的参考毒株为一群.结果表明,PEDV在华南地区猪场普遍存在,其基因也在不断发生变化.

关 键 词:猪流行性腹泻病毒  分子流行病学  基因进化分析

Investigation and analysis on molecular epidemiology of porcine epidemic diarrhea virus in south China
WANG Shuan-qun,SUN Rui-qin,LIU Yan-ling,XIA Ping-an,SONG Chang-xu.Investigation and analysis on molecular epidemiology of porcine epidemic diarrhea virus in south China[J].Guangdong Agricultural Sciences,2015,42(6):91-96.
Authors:WANG Shuan-qun  SUN Rui-qin  LIU Yan-ling  XIA Ping-an  SONG Chang-xu
Abstract:
Keywords:porcine epidemic diarrhea virus  molecular epidemiology  gene evolution analysis
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