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茶树Whirly基因家族的鉴定与表达分析
引用本文:张续周,周艳华,王悦燕,李波,王缓,郑仪倩,王玉,郎旭旭,钱文俊.茶树Whirly基因家族的鉴定与表达分析[J].南方农业学报,2022,53(9):2537-2546.
作者姓名:张续周  周艳华  王悦燕  李波  王缓  郑仪倩  王玉  郎旭旭  钱文俊
作者单位:1. 青岛职业技术学院, 山东青岛 266555;2. 山东省海阳市科学技术局, 山东烟台 265100;3. 青岛农业大学园艺学院, 山东青岛 266109
基金项目:国家自然科学基金项目(31800588)山东省良种工程子课题(2321401)青岛农业大学科研启动基金项目(1118025)青岛职业技术学院2020年重点研发专项(2020ZDYF09)
摘    要:【目的】对茶树Whirly基因家族成员进行鉴定及表达分析,为进一步探究Whirly基因家族在茶树生长发育和逆境响应的作用机理提供参考。【方法】以茶树品种北茶36、龙井43和大面白的叶片为材料,基于Whirly基因家族的保守结构特征,从茶树基因组鉴定CsWhys基因家族成员,利用生物信息学软件对其进行可视化分析,并对组织特异性和时空表达模式分析。【结果】从舒茶早茶树基因组中鉴定获得2个CsWhy基因,命名为CsWhy1(XP_028085682.1)和CsWhy2(XP_028102803.1)。系统进化树分析结果显示CsWhy1和CsWhy2蛋白分别与已知的定位于叶绿体和线粒体的Whirly蛋白聚为一类。CsWhys基因启动子区域富含激素、胁迫和MYB转录因子结合位点等顺式作用元件,种类呈多样性。组织表达特性分析显示,CsWhy1在茶树叶片和芽中具有较高的表达丰度;CsWhy2则在茶树不同组织中均具有较高的表达丰度。时空表达模式分析结果发现,CsWhys的表达在不同时间点受低温、干旱、ABA、GA和H2O2处理诱导上调。冷驯化条件下,CsWhy1在抗寒品种龙井43和不抗寒品种大面白中呈现相反的表达模式,而CsWhy2在2个品种中均下调表达。【结论】茶树基因组中2个CsWhys基因具有Whirly基因家族的典型特征,茶树CsWhys基因的表达具有明显的组织特异性,推测CsWhys基因家族在茶树芽叶生长和抗逆过程中起发挥了重要调控作用。

关 键 词:茶树    Whirly基因    组织特异性    非生物胁迫    冷驯化    表达分析
收稿时间:2021-10-08

Identification and expression analysis of Whirly gene families in Camellia sinensis (L.) O. Kuntze
ZHANG Xu-zhou,ZHOU Yan-hua,WANG Yue-yan,LI Bo,WANG Huan,ZHENG Yi-qian,WANG Yu,LANG Xu-xu,QIAN Wen-jun.Identification and expression analysis of Whirly gene families in Camellia sinensis (L.) O. Kuntze[J].Journal of Southern Agriculture,2022,53(9):2537-2546.
Authors:ZHANG Xu-zhou  ZHOU Yan-hua  WANG Yue-yan  LI Bo  WANG Huan  ZHENG Yi-qian  WANG Yu  LANG Xu-xu  QIAN Wen-jun
Institution:1. Qingdao Technical College, Qingdao, Shandong 266555, China;2. Haiyang Science and Technology Bureau, Yantai, Shandong 265100, China;3. Qingdao Agricultural University, College of Horticulture, Qingdao, Shandong 266109, China
Abstract:
Keywords:
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