| 单宁酸对嗜水气单胞菌转录组影响的研究 |
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| 引用本文： | 曾成容,刘馨,张晨旭,毕文文,梅世慧,何广霞,张峻杰,文明,周碧君,陈江凤,姜海波.单宁酸对嗜水气单胞菌转录组影响的研究[J].中国预防兽医学报,2023(9):895-904. |
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| 作者姓名： | 曾成容 刘馨 张晨旭 毕文文 梅世慧 何广霞 张峻杰 文明 周碧君 陈江凤 姜海波 |
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| 作者单位： | 1. 贵州大学动物科学学院;2. 贵州省动物生物制品工程技术研究中心 |
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| 基金项目： | 贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2020]1Y104号、黔科合支撑[2022]YB142号)； |
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| 摘 要： | 嗜水气单胞菌作为水产养殖业中的主要病原菌，严重危害该产业的发展。为探究单宁酸对嗜水气单胞菌的抑菌作用及其转录组的影响，本实验将单宁酸2倍倍比稀释(8μg/mL～8 192μg/mL)后，测定单宁酸对嗜水气单胞菌ATCC 7966株的最小抑菌浓度(MIC)；将嗜水气单胞菌分别与不同浓度的单宁酸共培养，根据所测细菌OD600nm值(共测24 h)，绘制细菌的生长曲线。结果显示，单宁酸对嗜水气单胞菌的MIC为2 048μg/mL；浓度低于64μg/mL (临界值)单宁酸处理后不影响嗜水气单胞菌的生长。因此本实验采用64μg/mL的单宁酸与嗜水气单胞菌ATCC 7966株共培养，每组重复4次，12 h后提取各组嗜水气单胞菌总RNA，反转录为cDNA后构建cDNA文库，再利用随机引物，经PCR扩增、定量后，采用Illumina HiSeq测序平台进行转录组测序(RNA-Seq)。通过计算每个样品中r RNA的占比(rRNA%)及碱基的错误率对测序数据质控；采用Bowtie2将获得的各组嗜水气单胞菌测序数据与GenBank中嗜水气单胞菌ATCC 7966株参考基因组比对，分析它们之间的相似性。结果...
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| 关 键 词： | 嗜水气单胞菌 单宁酸 转录组 |
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