| 2015年～2021年我国东部地区猪流行性腹泻病毒S1蛋白关键表位的变异分析 |
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| 引用本文： | 程亚豪,胡灵子,刘雅琦,周莹珊,杜静,周兴东,王晓杜,吴瑗,董婉玉.2015年～2021年我国东部地区猪流行性腹泻病毒S1蛋白关键表位的变异分析[J].中国预防兽医学报,2023(9):968-972. |
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| 作者姓名： | 程亚豪 胡灵子 刘雅琦 周莹珊 杜静 周兴东 王晓杜 吴瑗 董婉玉 |
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| 作者单位： | 1. 浙江农林大学动物科技学院/动物医学院,浙江省畜禽绿色生态健康养殖应用技术研究重点实验室/动物健康互联网检测技术浙江省工程实验室/动物医学与健康管理浙江省国际科技合作基地/中澳动物健康大数据分析联合实验室;2. 金华职业技术学院农学院 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(31972656)； |
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| 摘 要： | 为了解2015年～2021年我国东部地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行特征和遗传变异规律，本研究利用RT-PCR扩增2015年～2017年11株分离自浙江地区PEDV流行株的S1基因序列，并与GenBank中我国东部地区(上海、江苏、山东、河南和安徽)的86株PEDV流行株的S1基因序列通过MEGA 7.0软件比较分析S1基因的遗传进化关系，采用CLC Sequence Viewer 8软件分析比对S1蛋白氨基酸序列的变异。PEDV S1基因遗传进化分析结果显示，97株PEDV中有92%的流行株属于G2型，与疫苗株CV777同源性较低(90.4%～96.1%)，山东地区2017年～2018年间的部分流行株与疫苗株CV777等属于G1型；G2型中，33%的流行株属于G2a型，67%的流行株属于G2b亚型，其中2019年～2021年的流行株有15%流行株属于G2a亚型，85%的流行株属于G2b亚型。S1蛋白关键表位的变异分析结果显示，与经典株CV777相比，中和表位COE (CO-26K equivalent epitope)发生8个氨基酸位点(A517S、S
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 S1基因 遗传变异 序列分析 |
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