嗜吞噬细胞无形体ZJ-msp4基因的生物信息学分析

为了利用生物信息学预测嗜吞噬细胞无形体ZJ-msp4蛋白的优势抗原表位,给寻找无形体病诊断和预防的候选抗原表位提供参考,试验参照Gen Bank中的msp4基因序列(登录号为EU008082.1)进行生物信息学分析。结果表明:ZJ-msp4蛋白的分子质量为30.1 ku,理论等电点为5.71,该蛋白的不稳定系数为29.13,组成较多的氨基酸有丝氨酸(Ser,13.8%)、甘氨酸(Gly,9.2%)、丙氨酸(Ala,8.9%)等;二级结构预测ZJ-msp4蛋白主要以无规卷曲、延伸链、α螺旋为主,TMHMM2.0预测该蛋白的第7~29位氨基酸可能为跨膜区,该跨膜区可能为信号肽序列;Signal P 4.1预测在msp4蛋白的N端第1~29位氨基酸序列为信号肽序列,该分析结果与TMHMM2.0分析结果一致;B细胞表位预测该msp4蛋白有11个线性表位,其中以28~38位、64~77位、87~101位、134~143位、245~264位是ZJ-msp4蛋白的优势抗原表位区段,可以作为诊断无形体病的候选表位。