基于网络药理学和分子对接探究诃子鞣酸防治奶牛子宫内膜炎的作用机制 |
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引用本文: | 刘鑫煜,崔强,张兰欣,范佺荣,李政忆,高瑞峰.基于网络药理学和分子对接探究诃子鞣酸防治奶牛子宫内膜炎的作用机制[J].中国畜牧兽医,2023(4):1632-1641. |
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作者姓名: | 刘鑫煜 崔强 张兰欣 范佺荣 李政忆 高瑞峰 |
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作者单位: | 1. 内蒙古农业大学兽医学院;2. 呼和浩特海关技术中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(32160856); |
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摘 要: | 【目的】基于网络药理学结合分子对接技术探究诃子鞣酸防治奶牛子宫内膜炎的作用,并阐明其潜在机制。【方法】通过SwissTargetPrediction和PharmMapper数据库收集和预测诃子鞣酸的作用靶点,通过UniProt数据库标准化并去重。从OMIM和DRUGBANK数据库中获取奶牛子宫内膜炎相关基因并去重,绘制Venn图获取诃子鞣酸和奶牛子宫内膜炎交集靶点。使用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,使用DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。利用分子对接技术对KEGG通路富集分析后得到的关键通路靶点进行分子对接,以验证网络药理学分析结果的准确性。【结果】通过多个数据库检索及筛选获得诃子鞣酸潜在靶点基因333个,奶牛子宫内膜炎相关靶点基因342个,共有18个交集靶点。PPI结果显示,诃子鞣酸可能作用于前列腺素-内过氧化物酶合酶1(prostaglandin G/H synthase 1,PTGS1)、PTGS2、花生四烯酸12-脂氧合酶(arachidonate 12-lipoxygenase, ALOX12)、ALOX15等18个关键靶点。GO功能...
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关 键 词: | 诃子鞣酸 奶牛子宫内膜炎 网络药理学 靶点 分子对接 |
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