苏紫猪SLA-1基因多态性及其抗病潜能分析 |
| |
引用本文: | 王泽平,王飞飞,张芮铭,付言峰,赵为民,戴超辉,程金花,廖超,李辉.苏紫猪SLA-1基因多态性及其抗病潜能分析[J].中国畜牧兽医,2023(5):1918-1927. |
| |
作者姓名: | 王泽平 王飞飞 张芮铭 付言峰 赵为民 戴超辉 程金花 廖超 李辉 |
| |
作者单位: | 1. 江苏省农业科学院宿迁农科所;2. 江苏省农业科学院畜牧研究所 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金(32272883);;江苏省自然科学基金(BK20211140);;国家生猪产业技术体系(CARS-35);;江苏省农业科技自主创新资金(CX(22)3197); |
| |
摘 要: | 【目的】探究苏紫猪白细胞抗原-1(swine leukocyte antigen-1,SLA-1)基因多态性,并对其抗病潜能进行分析,以期为苏紫猪分子育种提供理论基础。【方法】以苏紫猪血细胞cDNA为模板,用PCR法扩增苏紫猪SLA-1基因并测序,利用DNAStar和Mega 5.0软件分别进行相似性分析及系统进化树构建;利用NetMHCpan 4.1 server分析SLA-1与非洲猪瘟病毒(African swine fever virus, ASFV)抗原表位结合的能力及特征;运用生物学软件对其编码蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区、结构和功能等进行预测。【结果】试验成功扩增6条苏紫猪SLA-1等位基因序列,分别为SLA-1*sz01、SLA-1*sz02、SLA-1*sz03、SLA-1*sz04、SLA-1*sz05和SLA-1*sz06,其高变异位点主要位于肽结合沟(peptide-binding groove, PBG)α1区和α2区;相似性比对结果显示,6条苏紫猪SLA-1等位基因核苷酸、氨基酸序列相似性分别在92.9%~96.9%、87.0%~94.8%之间,与不同品...
|
关 键 词: | 苏紫猪 SLA-1基因 多态性 抗原结合位点 抗病潜能 |
|
|