| 基于高通量测序的梅花鹿卵巢衰老的转录组分析 |
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| 引用本文： | 林乐丰,刁云飞,范冰峰,刘理想,邵静,赵向远,许保增.基于高通量测序的梅花鹿卵巢衰老的转录组分析[J].中国畜牧兽医,2023(8):3157-3170. |
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| 作者姓名： | 林乐丰 刁云飞 范冰峰 刘理想 邵静 赵向远 许保增 |
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| 作者单位： | 1. 中国农业科学院特产研究所;2. 特种经济动物分子生物学国家重点实验室;3. 吉林农业科技学院动物科技学院 |
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| 基金项目： | 吉林省科技发展计划项目(20210202127NC)；;中国农业科学院科技创新计划支持(CAAS-ASTIP-2015-ISAPS)； |
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| 摘 要： | 【目的】获取青年梅花鹿和老年梅花鹿卵巢组织的转录组信息，为深入研究梅花鹿卵巢衰老的潜在机制提供依据。【方法】以4岁龄青年梅花鹿和10岁龄老年梅花鹿卵巢作为试验样本，对样本进行石蜡切片、苏木精-伊红染色和卵泡计数；用Trizol法提取卵巢样本RNA构建转录组文库，应用Illumina HiSeqTM2000测序平台测序，对测序结果进行差异表达基因、GO功能、KEGG通路和蛋白互作网络分析，并挑选部分差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证。通过RIPA裂解液提取卵巢样本蛋白并对组蛋白H3赖氨酸4三甲基化(H3K4me3)蛋白在青年和老年梅花鹿中的表达情况进行Western blotting检测。【结果】组织学分析结果表明，老年梅花鹿的卵巢卵泡数显著低于青年梅花鹿(P<0.05),而闭锁卵泡数极显著高于青年梅花鹿(P<0.01)。转录组学分析结果表明，老年和青年梅花鹿卵巢间共有1 477个差异表达基因，其中表达上调基因503个，表达下调基因974个。GO功能和KEGG通路富集结果表明，免疫系统过程、转录、DNA损伤修复、炎症反应、凋亡等生物事件与卵巢衰老有关...
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| 关 键 词： | 梅花鹿 卵巢衰老 RNA-Seq H3K4me3 |
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