甘肃马鹿MyoG基因5′UTR单核苷酸多态性检测及其序列变异分析

为了初步探索肌细胞生成素(MyoG)基因在鹿科动物上的遗传多态性，试验采集56头甘肃马鹿的血液样品，采用PCR-SSCP和克隆测序的方法对MyoG基因(GenBank登录号：FJ746497)5′UTR部分序列进行了单核苷酸多态性(SNPs)检测及序列变异分析。结果表明：①引物P1的PCR扩增片段存在多态性，经克隆测序分析，在5′UTR -237 bp处存在G→A的转换变异，该位点表现为AA、AB和BB 3种基因型，由A和B 2个等位基因控制；对基因型、等位基因频率及群体遗传多态性分析结果发现，AA基因型频率最高，A基因为优势等位基因，该位点多态信息含量(PIC=0.194)为低度多态(PIC＜0.25)；经TFSEARCH 1.3分析软件预测发现，该变异可能减少了1个Sp1转录因子。②引物2的PCR扩增片段检测到1个SNP多态位点(—46 bp，G→A)，表现为CC、CD和DD 3种基因型, 基因型频率分布为CC＞CD＞DD，该位点多态信息含量(PIC=0.266)为中度多态(0.25＜PIC＜0.5)，但该变异并未引起潜在调控元件及蛋白质结合位点的改变。本研究结果为进一步分析MyoG基因SNPs位点与甘肃马鹿胴体、肉质性状的关联性奠定了基础。