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大熊猫核糖体蛋白S17亚基基因(rps17)的克隆及序列分析
引用本文:侯怡铃,李俊,侯万儒.大熊猫核糖体蛋白S17亚基基因(rps17)的克隆及序列分析[J].西南农业大学学报,2011,33(8).
作者姓名:侯怡铃  李俊  侯万儒
作者单位:西南野生动植物资源保护教育部重点实验室;西华师范大学生命科学学院;
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30470261); 四川省应用技术资助项目(2006J13-057); 四川省教育厅重点科研项目(07ZA120);四川省教育厅青年基金资助项目(09ZB088); 四川省重点学科动物学建设经费资助项目(404001); 四川省应用基础资助项目(2009JY0061)
摘    要:RPS17蛋白是核糖体40S亚基的组成部分,由rps17基因编码.为了解大熊猫核糖体蛋白亚基rps17基因的结构特点及其与已报道的人和其他哺乳动物核糖体蛋白亚基rps17基因的异同,分别运用RT-PCR和PCR技术,从大熊猫肌肉组织的mRNA中成功克隆了核糖体蛋白亚基S17基因的cDNA序列以及从总DNA中成功克隆了S17基因的结构基因序列.序列分析发现,大熊猫核糖体蛋白亚基S17基因的表达序列长为457bp,开放阅读框(ORF)为408bp,编码135个氨基酸的蛋白质.结构基因序列长2 368bp,含有4个外显子和3个内含子.拓扑预测显示,核糖体蛋白亚基RPS17的相对分子质量为15.52×103,PI为10.26,含有5个类型的功能位点,即:5个蛋白激酶C磷酸化位点,1个酪蛋白激酶II磷酸化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点,1个N-豆蔻酰化位点及1个核糖体蛋白S17Esignature位点.进一步分析发现,该基因的表达序列及其编码的氨基酸序列与已报道的部分哺乳动物有很高的相似性,其蛋白质的高级结构除褐家鼠外与其它物种也具有一致性.对大熊猫rps17基因及其表达的蛋白质结构的比较研究,旨在丰富和完善哺乳动物r...

关 键 词:大熊猫  RT-PCR  rps17  克隆  序列分析  

Cloning and Sequence Analysis of Ribosomal Protein S17 Gene(rps17) from Giant Panda
HOU Yi-ling,LI Jun,HOU Wan-ru .Key Laboratory of Southwest China Wildlife Resources Conservation,Nanchong Sichuan ,China,.College of Life Science,China West Normal University.Cloning and Sequence Analysis of Ribosomal Protein S17 Gene(rps17) from Giant Panda[J].Journal of Southwest Agricultural University,2011,33(8).
Authors:HOU Yi-ling  LI Jun  HOU Wan-ru Key Laboratory of Southwest China Wildlife Resources Conservation  Nanchong Sichuan  China  College of Life Science  China West Normal University
Institution:HOU Yi-ling,LI Jun,HOU Wan-ru 1.Key Laboratory of Southwest China Wildlife Resources Conservation(Ministry of Education),Nanchong Sichuan 637009,China,2.College of Life Science,China West Normal University
Abstract:RPS17 is a component of the 40S small ribosomal subunit encoded by rps17 gene.To learn the structure characteristics of ribosomal protein S17 gene(rps17) of giant panda(Ailuropoda melanoleuca) and understand its similarities to and differences from rps17 of human and other mammal species,we designed primers based on the known nucleotide sequence of ribosomal protein S17 gene(rps17).RT-PCR and PCR strategies were employed to successfully isolate cDNA and genome of rps17 from the giant panda.Sequence analysis...
Keywords:giant panda  RT-PCR  rps17  cloning  sequences analysis  
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