普通烟草VQ家族基因的鉴定及表达

VQ家族是一类植物特有的家族，被报道参与生长发育、生物和非生物逆境胁迫响应等过程。本研究利用生物信息学和比较基因组学的方法，在烟草基因组中对VQ家族成员进行鉴定，并进行进化分析、共线性分析、复制分析以及表达模式等分析。本研究从烟草基因组中鉴定出57个VQ家族成员编码基因，其中33个普通烟草VQ基因被锚定到染色体上。系统发育分析发现，普通烟草和拟南芥的VQ家族成员被分成了9个亚家族。共线性分析表明，普通烟草NtVQ23与拟南芥中的AtVQ16形成共线性基因对。同时，对烟草基因组中的复制事件分析表明，全基因组重复事件在VQ家族成员的扩张中发挥着重要作用。此外，还对部分VQ家族成员的表达模式进行了分析，结果表明VQ基因的表达具有组织特异性，NtVQ9、NtVQ26等基因能够被青枯病接种和盐胁迫处理显著诱导。本研究对普通烟草VQ家族成员进行了鉴定与分析，为其后续研究VQ家族成员的功能提供了一定基础。