铁皮石斛中性/碱性转化酶家族基因的克隆和表达分析 |
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作者姓名: | 苗小荣 牛俊奇 王爱勤 黄维 何龙飞 |
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作者单位: | 1. 玉林师范学院生物与制药学院;2. 广西大学农学院;3. 玉林师范学院广西农产资源化学与生物技术重点实验室 |
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基金项目: | 国家中药材产业技术体系建设项目(CARS-21); |
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摘 要: | 为了探究铁皮石斛中性/碱性转化酶(neutral/alkaline invertase, NI)家族基因的生物学特性和组织表达特性,本试验从铁皮石斛转录数据库中筛选DoNI基因,采用PCR技术克隆到4个新的铁皮石斛DoNI家族基因,分别命名为DoNI1、DoNI3、DoNI4和DoNI5,并利用生物信息学软件分析家族蛋白的理化特性,采用荧光定量PCR检测和分析该家族基因的时空表达特性。结果显示:DoNI1、DoNI3、DoNI4和DoNI5分别编码611、651、554和555 aa,其蛋白分子量为63.18~73.23 kD,等电点为5.84~6.66,氨基酸序列同源性为50%~90%。具有中性转化酶的保守结构域,属于糖基水解酶GH100家族。DoNI1属于线粒体型,DoNI3属于叶绿体型,DoNI4和DoNI5属于细胞质型。在铁皮石斛花、茎、叶和根中都能检测到DoNI家族基因的表达,DoNI1和DoNI3在根中基因表达量最高,DoNI4和DoNI5在花中基因表达量最高。DoNI1在2年生茎中基因表达量最高,1年生茎中次之,3年生茎中最低。不同生长年限茎中的DoNI3与DoNI1基因...
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关 键 词: | 铁皮石斛 中性/碱性转化酶 生物信息学分析 基因表达 |
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