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人参CLE多肽的系统鉴定及其功能分析
作者姓名:李天笑  李琛  孙彻  蒋超  刘娟  黄璐琦
作者单位:1. 广东药科大学中药学院;2. 湖北医药学院基础医学院药用植物实验室武当特色中药研究湖北省重点实验室;3. 中国中医科学院中药资源中心
基金项目:国家自然科学基金常规面上项目(81974516)和国家自然科学基金项目青年科学基金项目(81703653)共同资助;
摘    要:CLE(CLAVATA3/Embryo surrounding region-related)多肽对植物根的生长发育具有重要调控作用。本研究采用生物信息学方法对人参CLE基因进行鉴定,对其基序进行了比对、偏好性分析,并采用全长进行了系统进化分析,对人参CLE基序在根的生长发育功能进行初步研究。结果表明,从人参基因组及转录组对应的蛋白库中鉴定出15种人参CLE多肽序列,对应21个基因,命名为PgCLE+数字,其中11种多肽序列为首次报道;多序列比对及偏好性分析表明,人参PgCLE与拟南芥CLE的同源多肽较为一致,但是部分人参CLE在第3位氨基酸上表现出了对A氨基酸的偏好性;系统进化树表明,PgCLE1、PgCLE3、PgCLE5、PgCLE6、PgCLE25a/b、PgCLE26、PgCLE27、PgCLE45a/b/c/d聚类在一起,PgCLE9、PgCLE12、PgCLE14a/b、PgCLE16、PgCLE20、PgCLE41、PgCLE44a/b聚类在一起,均同拟南芥对应的CLE亲缘关系较近;采用人参不定根系统研究发现,PgCLE9、PgCLE14、PgCLE16、PgCLE20...

关 键 词:人参(Panax ginseng)  根型  CLE多肽  不定根  初生根根长
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