| 梨ERF超家族全基因组鉴定及表达分析 |
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| 引用本文： | 钟必凤,邓家林,李文贵,张全军.梨ERF超家族全基因组鉴定及表达分析[J].分子植物育种,2019,17(12):3874-3886. |
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| 作者姓名： | 钟必凤 邓家林 李文贵 张全军 |
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| 作者单位： | 四川省农业科学院园艺研究所,农业部西南地区园艺作物生物学及种质创制重点实验室,成都,610066;四川省农业科学院园艺研究所,农业部西南地区园艺作物生物学及种质创制重点实验室,成都,610066;四川省农业科学院园艺研究所,农业部西南地区园艺作物生物学及种质创制重点实验室,成都,610066;四川省农业科学院园艺研究所,农业部西南地区园艺作物生物学及种质创制重点实验室,成都,610066 |
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| 基金项目： | 四川省财政育种工程青年基金;成都市科技项目 |
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| 摘 要： | 中国南方地区普遍存在的由于干旱等原因提早落叶导致的梨二次花现象给生产带来了很大的损失,且该过程可以通过人工摘叶处理进行模拟诱导。乙烯响应因子ERF成员被认为参与了植物的激素应答、生物和非生物胁迫以及生长发育调控过程。本研究基于公开的白梨基因组序列,利用生物信息学方法对其中的ERF因子进行鉴定,并对其分组及各组结构域进行了详细分析。结合课题组采用摘叶诱导二次花形成过程中的梨转录组数据,分析了响应该过程的ERF成员。结果表明,共获得了 211个白梨ERF家族编码基因,并可根据系统进化关系和结构域保守性分为11个组,其中种特有组一个。砂梨摘叶诱导二次花过程的转录组数据分析表明,有37个ERF因子差异表达,摘叶初期(摘叶后7 d)无响应,中期(摘叶后17 d)以下调表达为主,后期上调。对其中的4个差异表达基因进行了实时荧光定量PCR分析验证,结果与转录组分析结果吻合。此研究进一步丰富了梨响应胁迫反应的ERF基因资源,为进一步探讨ERF在成花过程中的作用提供了理论依据。
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| 关 键 词： | 梨 乙烯响应因子 二次花 基因家族 |
Genome-wide Identification and Their Expression Analysis of Ethylene-Responsive Factors (ERF) Superfamily in Pear |
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| Zhong Bifeng,Deng Jialin,Li Wengui,Zhang Quanjun.Genome-wide Identification and Their Expression Analysis of Ethylene-Responsive Factors (ERF) Superfamily in Pear[J].Molecular Plant Breeding,2019,17(12):3874-3886. |
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| Authors: | Zhong Bifeng Deng Jialin Li Wengui Zhang Quanjun |
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| Institution: | (Key Laboratory of Horticultural Crops, Biology and Germplasm Enhancement in Southwest Regions, Ministry of Agriculture, Horticultural Research Instituteof Sichuan Academy of Agricultural Sciences, Chengdu, 610066) |
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| Abstract: | Zhong Bifeng;Deng Jialin;Li Wengui;Zhang Quanjun(Key Laboratory of Horticultural Crops, Biology and Germplasm Enhancement in Southwest Regions, Ministry of Agriculture, Horticultural Research Instituteof Sichuan Academy of Agricultural Sciences, Chengdu, 610066) |
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| Keywords: | Pear Ethylene-responsive factors (ERF) Early defoliation Gene family |
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