迷宫栓孔菌热激蛋白基因的生物信息学与表达分析

为了探究迷宫栓孔菌（Trametes gibbosa）热激蛋白（heat shock proteins, HSPs）家族的功能及结构，对经木屑处理不同时间点的菌丝样品进行cDNA建库，然后根据转录组数据筛选该菌株的所有HSPs基因并进行生物信息学分析；针对HSP100家族进行基因克隆和序列结构分析，并利用实时荧光定量聚合酶链反应（real-time fluorescent quantitative polymerase chain reaction, qRT-PCR）对其在木屑处理下的表达量进行验证。结果如下：在迷宫栓孔菌中共筛选出32个HSPs基因，其编码的蛋白分为5个亚类，分别为HSP100(2个)、HSP90(2个)、HSP70(7个)、HSP60(1个)和小分子热激蛋白small HSPs(sHSPs),20个]，它们在菌体生长调控中具有蛋白翻译后修饰、蛋白质折叠、伴侣蛋白等重要功能。这些HSPs都为疏水蛋白，不同亚类的HSPs理化性质有所差异。HSP100由N-端、核苷酸结合域1(nucleotide-binding domain 1, NBD1)、NBD2、2个NBDs间...